Influence des ligands et de la structure lors de l'attaque radiolytique de l'adn

Dna radiolysis: ligands and structure effects

• Auteur / Autrice : Valérie Isabelle
• Direction : Michel Charlier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1994
• Etablissement(s) : Orléans

Résumé

Parmi les nombreux dommages causes a l'adn par les radiations ionisantes (rayons et neutrons rapides), les coupures de chaine resultent de l'attaque par les radicaux hydroxyle. Ces coupures de chaines, tres importantes pour le devenir de la cellule, ont ete utilisees pour etudier la radioprotection par les proteines fixees, ainsi que l'influence de la structure sur l'attaque radiolytique. Nous avons etudie la radioprotection de l'adn par la proteine chromosomique mc1, issue d'une archaebacterie methanosarcina sp. Chti55. La relaxation-linearisation du plasmide permet de doser le nombre de coupures simple et double brin en fonction de la couverture du plasmide en proteine. Nous avons montre qu'a couverture complete, la protection contre les coupures double brin est totale alors que restent accessibles la moitie environ des sites de coupure simple brin. La technique d'empreinte moleculaire par radiolyse a permis de proposer un modele de structure des complexes adn-mc1. Des fragments de restriction totalement couverts par mc1 montrent une periodicite d'attaque qui correspond a la longueur du site exclu par la proteine: 11 paires de bases. L'application de cette methode d'empreinte moleculaire par radiolyse permet de connaitre les conditions d'accessibilite des oh- en fonction de la structure de l'adn. Nous avons montre que l'attaque radiolytique a la meme probabilite de coupures a tous les sites nucleotidiques de l'adn, qu'il soit en simple brin, en double brin ou en triple helice. Cependant, certaines conformations particulieres de l'adn ont une reponse specifique par rapport a l'adn canonique. Ainsi les sequences 5'-aatt sont legerement radioresistantes du fait de la courbure et du retrecissement du petit sillon. De meme, quand une guanine est fortement exposee au solvant, dans une configuration particuliere de l'adn, elle est nettement plus attaquee que dans une helice classique