Reconnaissance, coupure et dosage des sites abasiques de l'ADN : synthèse et étude de molécules spécifiques
Auteur / Autrice : | Ali Boudali |
Direction : | Jean Lhomme |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Chimie |
Date : | Soutenance en 1994 |
Etablissement(s) : | Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015) |
Résumé
Notre travail s'inscrit dans le cadre d'un programme d'etudes d'une lesion majeure de l'adn, le site abasique (site-ap). La premiere partie est consacree a la reconnaissance et la coupure des sites abasiques de l'adn par des endonucleases artificielles de structure base-chaine-intercalant: un intercalant a forte affinite pour l'adn (derive de 9-aminoacridine) sert de vecteur, une base nucleique reconnait la loge abasique, et une chaine de jonction aliphatique polyaminee contient l'activite de coupure. Pour preciser le mode d'action de ces molecules, nous avons synthetise une serie d'analogues dans lesquels nous avons change la base nucleique et la nature de la chaine de jonction (fonctions amines secondaires, tertiaires, amides). L'activite endonucleasique a ete determinee a l'aide de plasmide pbr 322 a site-ap. Dans la seconde partie, nous nous sommes interesses au dosage specifique de cette lesion (site abasique) par des sondes fluorescentes de structure fluorophore-chaine de jonction-alkoxyamine. La fonction alkoxyamine reagit specifiquement avec le site abasique dans sa forme aldehyde ouverte et le fluorophore permet de visualiser la fixation sur l'adn a l'aide de methodes spectroscopiques. Nous decrivons la synthese de ces molecules et les premieres etudes de reactivite vis-a-vis d'aldehydes simples et de l'adn contenant des sites abasiques