La nucleoline : proteine modele dans l'etude de motifs peptidiques de fixation aux acides nucleiques

Nucleolin: a model-protein to study nucleic acid binding peptide motifs

• Auteur / Autrice : ABDELHAKIM KHARRAT
• Direction : Monique Erard
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1993
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Mots clés

Mots clés contrôlés

Protéines chromosomiques

ARN

Spectroscopie infrarouge

Relations structure-activité

Acides nucléiques

Résumé

La nucleoline, de par sa structure composee d'elements varies - motifs acides, motifs basiques, domaines de fixation a l'arn, domaine riche en residus glycine et arginine - constitue l'exemple type d'une proteine modulaire a plusieurs fonctions. En utilisant un peptide-modele representatif du motif basique repete de la partie amino-terminale de la nucleoline, nous avons pu montrer que l'hypercondensation mitotique de l'adn est assuree par l'action synergique de l'histone h1 et de la nucleoline, amplifiee par leur phosphorylation concertee par la proteine kinase p34#c#d#c#2. Par des etudes biochimiques et spectroscopiques d'interaction in vitro, nous avons etabli que la partie centrale de la nucleoline (domaines rrm) est porteuse de la specificite de reconnaissance de la nucleoline vis-a-vis de la region 5-ets (pour 5 external transcribed spacer) du gene ribosomique. Ces domaines rrm presentent une forte proportion de structures en helice et brin qui constitueraient une surface de contact avec l'arn comparable a celle demontree dans le cas de la proteine u1a (). En outre, il apparait que le domaine c-terminal, de par sa capacite a desempiler les plateaux de bases, de structure des regions de l'arn, permettant aux domaines rrm d'acceder a leurs sites de fixation specifique. D'autre part, le peptide correspondant au motif conserve rnp-1 des domaines rrms se fixe exclusivement sur les arns simple-brin, l'interaction mettant en uvre a la fois des residus hydrophobes et hydrophiles. Au vu de nos resultats, il s'avere que chaque type d'interaction entre un domaine ou microdomaine peptidique et une structure nucleotidique particuliere, mis en evidence chez la nucleoline, peut, dans une certaine mesure, servir de systeme-modele