Determination, par rmn, de la structure tridimensionnelle des peptides et des proteines : application a un peptide et deux toxines

Three dimensional structure determination of biomolecules by nmr: application to a peptide and two toxins

• Auteur / Autrice : YINSHAN YANG
• Direction : Eric Guittet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1993
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Ce travail a permis, grace a des techniques de resonance magnetique nucleaire (rmn) a 2 et 3 dimensions, a l'etude conformationnelle de peptides et de proteines en solution. Une premiere application concerne un peptide (23 acides amines) issu de la branche n-terminale de l'aspartyl-tarn synthetase. Il a ete montre par des experiences de dichroisme circulaire que le peptide en solution aqueuse interagit avec poly(dt). La technique de rmn 2d a ete utilisee pour attribuer les spectres proton. Sur la base des contraintes de distances inter-protonique tirees des experiences noesy, la structure tridimensionnelle du peptide a ete determinee. Ensuite la transition conformationnelle d'une proteine, l'alpha-cobratoxine (71 acides amines) en fonction du ph a ete etudie. L'attribution complete des resonances protoniques a ete realisee a ph neutre par differentes experiences de rmn 2d. La rmn couplee aux calculs de dynamique moleculaire a montre que la conformation globale etait conservee avec des differences locales en particulier au niveau de l'histidine 18. La structure d'une autre proteine, la sous-unite a de la crotoxine (90 acides amines) a ete egalement etudiee. L'attribution complete des resonances du proton a l'aide des experiences rmn-2d et 3d a ete effectuee. Les cartes 2d noesy ont permis l'evaluation des distances inter-protoniques qui constituent ainsi les contraintes pour les calculs de dynamique moleculaire