Thèse soutenue

Determination de la structure tridimensionnelle de la capsiceine en solution par resonance magnetique nucleaire multidimensionnelle
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Auteur / Autrice : Serge Bouaziz
Direction : Paul Vigny
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
Date : Soutenance en 1993
Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

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La capsiceine est une elicitine appartenant a une nouvelle famille de proteines. Elle est secretee par un champignon du genre phytophthora. Elle provoque chez les plantes telles que le tabac, une necrose foliaire mais stimule egalement les defenses de la plante contre l'invasion d'un autre champignon facteur du chancre noir. Deux types d'elicitines, presentant 85% d'homologie, ont ete isolees se differenciant par leur activite necrotique liee a leur point isoelectrique. Le but a long terme de l'etude par resonance magnetique nucleaire est de determiner si une difference de structure est liee a l'activite observee. Ce travail presente la determination de la structure tridimensionnelle de la capsiceine en solution par resonance magnetique nucleaire multidimensionnelle. Dans ce but, les experiences de rmn 3d homo- et heteronucleaires ont ete mises au point. Differentes methodologies d'attribution ont ete developpees, liees au type d'experience realisee. Celles-ci ont permis l'attribution des resonances protoniques et azote 15 de la capsiceine. L'experience homonucleaire 3d hohaha-noesy et les experiences 3d heteronucleaires hohaha-hmqc et noesy-hmqc sont largement detaillees. Un grand nombre de donnees experimentales ont ete obtenues et ont permis la reconstruction de la structure tridimensionnelle de la capsiceine tout d'abord par un programme de geometrie des distances (diana) puis par affinement de ces structures par dynamique moleculaire (xplor). La connaissance de la structure tridimensionnelle de la capsiceine va permettre maintenant l'etude des proteines homologues de la meme famille