Structure en solution et en milieu micellaire d'un peptide antibiotique : la trichorzianine tavii. etude par resonance magnetique nucleaire et modelisation

Structure of an antibiotic peptide in methanol and in sds micelles: trichorzianine tavii. Nuclear magnetic resonance and distance geometry algorythms studies

• Auteur / Autrice : YANN PRIGENT
• Direction : Jean-Jacques Basselier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1992
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

La trichorzianine tavii est un peptide antibiotique compose de 19 residus qui a la propriete de former, dans les bicouches phospholipides, ces canaux dont l'activite depend d'un potentiel trans-membranaire. Afin de tenter de comprendre le mecanisme d'action du peptide sur les membranes, l'etude structurale de tavii en solution dans le methanol et en milieu micellaire (rapport molaire sds/tavii=50) a ete realisee par resonance magnetique nucleaire #1h, #1#3c et #1#5n. Une attribution complete des signaux rmn a ete realisee pour ces trois noyaux. De nombreuses informations conformationnelles ont ete obtenues a l'aide d'experiences de rmn 2d (cosy-dqf, hohaha, noesy, roesy, hmqc, hm3c). Les valeurs de constantes de couplage 3jhn-ch, les coefficients de temperature des groupes nh et cc, les temps de relaxation longitudinaux #1#3c ont ete determines et les effets overhauser nucleaires analyses quantitativement. L'ensemble de ces resultats a permis de realiser la modelisation du peptide. Les conformations de la trichorzianine tavii en solution dans le methanol et en milieu micellaire, determinees par ces methodes, semblent similaires et sont caracterisees par une helice droite rigide, coudee au niveau des residus u#9-s#1#0 et incluant deux tours d'helice 3#1#0 au niveau de la proline et un tour mixte /3#1#0 en partie n-terminale. En presence de sds, tavii apparait aussi structure qu'en solution methanolique. Ces resultats suggerent que le mecanisme d'action de ce peptide sur les membranes met en jeu une reorientation globale de l'helice dans la bicouche et non un mouvement d'une partie du squelette peptidique