Structure de la sequence 29-39 du gene k-ras contenant des mesappariements par resonance magnetique nucleaire

Structure of dna mispairs in the sequence 29-39 of the k-ras gene by nmr

• Auteur / Autrice : YVES BOULARD
• Direction : Paul Vigny
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1992
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Les duplex d'adn 5d(gccaccagctc). D(gagctxgtggc) ou x peut etre une base g, a, c ou t ont ete etudies par rmn, mecanique et dynamique moleculaire. Le duplex contenant une paire de bases gc correspond a la sequence 29-39 du gene k-ras. Le mesappariement est integre au niveau de la premiere paire de bases du codon de la gly 12 correspondant a un point chaud de mutation. L'analyse des spectres noesy en d20 montre que les mesappariements sont integres a l'interieur de la double helice d'adn. Nous observons un changement de conformation des mesappariements en fonction du ph. Le pk apparent varie entre 7. 2 et 5. 7 suivant la nature du mesappariement. A ph acide, les sequences contenant les paires de bases ca ou cc sont protonees ce qui autorise la formation d'une seconde liaison hydrogene via la protonation du n1 de a pour le mesappariement ca ou du n3 de c pour le cc. Lorsque le ph de la solution augmente le proton supplementaire disparait et l'appariement ca change de conformation. A ph neutre, le mesappariement ct est ferme par deux liaisons hydrogene. Lorsque l'on diminue le ph de la solution, on observe la protonation du n3 de la cytosine du mesappariement ct et un changement de conformation de l'appariement toujours forme de deux liaisons hydrogene. Dans tous les cas, les paires de bases adoptent une conformation anti-anti