Mise en évidence et étude d'un intron de type intron de gènes nucléaires et protéines, présent dans les gènes du snrna u3 de la levure saccharomyces cerevisiae

An Intron in the u3 snrna genes of the yeast saccharomyces cerevisiae with the characteristic features of nuclear introns from premessenger rnas : discovery and study

• Auteur / Autrice : Véronique Segault
• Direction : Christiane Branlant
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1992
• Etablissement(s) : Nancy 1
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Saccharomyces cerevisiae

Introns

Levure (agent de fermentation)

Mots clés libres

Levure

Intron

Précurseur biosynthétique

Saccharomyces cerevisiae

Résumé

Nous avons montré la présence d'un intron de type intron de gènes nucléaires de protéines, dans les gènes codant pour le snrna u3 de s. Cerevisiae. Le pre-snrna u3 et épisse dans un spliceosome. S. Cerevisiae contient deux gènes a et b codant pour le snrna u3. Dans chacun l'intron est situé à la même position, mais à une taille et une séquence différente. Le gène b est présent chez les saccharomyces, mais pas chez les kluyveromyces et les pichia. La séquence des introns de type a est très conservée chez les saccharomyces, kluyveromyces et pichia. La détermination de la structure secondaire du snrna u3 de levure, en solution montre qu'il est constitué: d'un domaine 3 fortement structuré qui fixe les protéines de la snrnp u3 et d'un domaine 5, de structure plus lâche, qui interagit avec le pre-arn ribosomique. Ce domaine a une structure secondaire différente chez les eucaryotes inferieurs et chez les eucaryotes supérieurs. Nous avons aussi déterminé la structure secondaire du pre-snrna u3. La majorité des éléments de structure de l'arn mature se retrouvent dans le pre-arn. L'intron présente une longue structure tige-boucle centrale. Les sites fonctionnels sont regroupés dans l'espace. Ce qui favorise, sans doute, l'assemblage du spliceosome. L'épissage in vitro de différents pre-arn u3 mutes et chimériques montre que la conformation et la séquence du site de branchement sont des paramètres essentiels pour l'efficacité d'épissage et que l'addition d'un segment très structuré en 5 du premier exon augmente le taux d'épissage in vitro, lorsque la boite de branchement est gactaac