Adaptation des bacillus polymyxa du sol à la rhizosphère du blé : Approche populationnelle de la diversité

Adaptation of bacillus polymyxa to the rhizosphere of wheat : diversity studies using a populational approach

• Auteur / Autrice : Patrick Mavingui
• Direction : Thierry Heulin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 1992
• Etablissement(s) : Nancy 1
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Racines (botanique)

Blé

Rhizosphère

Résumé

Des souches de bacillus polymyxa ont été isolées du sol non-rhizosphérique, du sol rhizosphérique et du rhizoplan de blé à l'aide de l'immunopiegeage. Cette méthode utilise comme piège des anticorps polyclonaux de lapins dirigés contre une souche de l'espèce bacillus polymyxa. L'identification des souches isolées a été effectuée à l'aide de méthodes classiques basées sur les caractères morphologiques, physiologiques et biochimiques ainsi que l'utilisation des galeries api, en taxonomie numérique. La population de bacillus polymyxa a été estimée entre 200 et 600 mille bactéries par g de matière sèche. Une étude de la diversité fondée sur les caractères phénotypiques (galeries api), sérologiques (elisa) et génotypiques (rflp) a montré une variabilité plus importante pour la sous-population issue du sol alors que se dégage une relative homogénéité au sein de la sous-population du rhizoplan. Cette baisse de la diversité à la proximité des racines du blé serait un indice d'adaptation des bacillus polymyxa à cette niche écologique. L'utilisation du sorbitol semble être l'un des caractères d'adaptation des bacillus polymyxa à l'environnement racinaire du blé. La plante exerce donc une pression de sélection sur la sous-population de bacillus polymyxa qui lui est associée, en sélectionnant certains caractères trophiques et certaines activités enzymatiques (chitinases, protéases).