Contribution à l'étude de la diversité génotypique et des potentialités de transfert de plasmides parmi des isolats naturels de Rhizobium leguminosarum
Auteur / Autrice : | Eric Geniaux |
Direction : | Noëlle Amarger |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Sciences. Écologie microbienne |
Date : | Soutenance en 1992 |
Etablissement(s) : | Lyon 1 |
Jury : | Examinateurs / Examinatrices : Noëlle Amarger |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
72 rhizobium isoles de nodosites de haricot de diverses regions geographiques de france ont ete caracterises par analyses genetiques et phenotypiques. La structure de 2 populations naturelles est conservee entre 2 sites geographiques eloignes. 41 isolats sont determines comme r. Leguminosarum bv. Phaseoli. Les autres ne peuvent etre relies ni a l'espece r. Leguminosarum ni a l'espece r. Tropici et constituent 2 groupes genomiques distincts. Des transferts de psym entre bacteries genetiquement eloignees sont suspectes. Parmi un echantillon de 20 isolats d'une population naturelle de r. Leguminosarum bv. Viciae, 5 sont porteurs de psym conjugatifs. Des estimations des frequences de transfert de plasmides ont ete obtenues pour 2 psym de r. Leguminosarum bv. Viciae, 1 psym et 1 plasmide cryptique de r. Leguminosarum bv. Phaseoli. Les receveurs ont ete selectionnes dans la meme population naturelle de r. Leguminosarum bv. Viciae. Les 2 psym de viciae et le plasmide cryptique de phaseoli sont transferes a des frequences variant respectivement de 10#-#9 a 10#-#6 et de 10#-#9 a 10#-#3 pour 16 des 17 receveurs testes. Seuls 5 des 17 receveurs ont recu le psym de r. Leguminosarum bv. Phaseoli a des frequences variant de 10#-#9 a 10#-#8. Pour les 2 psym de viciae testes dans 2 genotypes differents, un effet principal du donneur et une interaction entre plasmides et receveurs regissent le nombre de transconjugants obtenus. La stabilite plasmidique des transconjugants porteurs de 2 psym a ete etudiee apres symbiose avec la plante: elle depend des groupes d'inoculation respectif des 2 psym et lorsqu'ils sont differents, de la plante-hote testee. Des rearrangements parmi les plasmides se produisent a frequences elevees dans les nodosites. Des resultats relatifs a la recherche d'une constante du transfert des plasmides chez rhizobium sont egalement presentes