Evolution de l'arn ribosomique 28s. Utilisation pour l'etude de la phylogenie des vertebres et de l'horloge moleculaire

Evolution of the 28s ribosomal rna molecule: implications for the study of vertebrate phylogeny and the molecular clock

• Auteur / Autrice : HOC LANH VAN LE
• Direction : André Adoutte
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1991
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

L'evolution d'une partie de la molecule d'arn ribosomique 28s est etudiee chez les vertebres. L'arbre phylogenetique, base sur environ 500 nucleotides, est construit par differentes methodes de distance et de parcimonie. Cet arbre moleculaire contient des branchements bien resolus et des arbres non resolus qui forment trois points de multifurcation. En general, les points resolus confirment la phylogenie morphologique, a deux exceptions pres: lophius se positionne a l'interieur des percomorphes et les ostariophyses associes aux clupeomorphes forment un groupe monophyletique. La multifurcation au niveau de l'emergence des groupes de chondrichthyens, de tetrapodes et d'actinopterygiens, semble refleter une radiation paleontologique. Une approche de calcul pour l'estimation des dates de divergence est proposee et appliquee aux actinopterygiens. A la lumiere des dates de divergence estimees, une nouvelle analyse des points non resolus confirme l'arbre phylogenetique morphologique (sauf dans le cas de l'esturgeon (acipenser) qui emerge avec les polypterides). L'evolution de la structure secondaire de la molecule est etudiee au cours de l'histoire evolutive des vertebres. Cette etude montre que les caracteres de la structure secondaire peuvent etre utilisees a des fins phylogenetiques. Deux constatations emergent de ce travail: 1) l'evolution de la structure primaire est independante de l'evolution de la structure secondaire; et 2) l'appariement g-u est la forme transitoire du changement de a-u vers g-c