Les effets de contextes de codons : precision de la traduction

Codon context effects: translational alluracy

• Auteur / Autrice : PIA MOLLER SORENSEN
• Direction : Richard Buckingham
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1991
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

La precision de l'elongation au cours de la synthese proteique est optimisee mais non portee a son maximum. Des erreurs, telles que des lectures inexactes, des changements de cadre de lecture et des detachements ribosomiques apparaissent avec une frequence mesurable. Les facteurs impliques dans la modulation des frequences d'erreur peuvent etre: l'usage des codons, les contextes de codon et le niveau des modifications des arnt. Les effets de contextes dans les suppressions non-sens furent examines d'une maniere approfondie. Une partie de ces effets derive de la variation d'efficacite des facteurs du detachement ribosomique. Dans cette these le systeme defini, base sur le couplage entre les genes trpa et trpb, a ete utilise pour elucider les effets de contexte. Ces etudes systematiques revelent des effets de contexte a la fois avec les suppressions faux-sens et non-sens. Les bases situees en 3 et en 5 du codon supprime donnent une variation de l'efficacite des suppresseurs. Les effets de bases situes en 5 peuvent etre expliques par des interactions arnt-arnt sur le ribosome. Tandis que pour expliquer les effets des bases en 3, des interactions plutot indirectes comme des structures locales d'arnm (par exemple les courbures), des interactions arnm-ribosome, ou des interactions ef-tu-arnm doivent etre envisagees