Vers la classification automatique des chromosomes

Towards automatic chromosome classification

• Auteur / Autrice : XIAOHUI QIU
• Direction : Dominique Barba
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1990
• Etablissement(s) : Nantes

Résumé

Les travaux effectues dans le cadre de cette these, s'inscrivent dans la perspective de la conception et la realisation d'un systeme de classification entierement automatique des chromosomes. Celui-ci doit a partir de l'image numerisee d'une metaphase, engendrer la reconnaissance et le classement de tous les chromosomes de cette metaphase (le caryotype). D'abord, avec l'aide des cytogeneticiens, nous avons recueilli et repertorie les connaissances humaines mises en jeu dans l'elaboration d'un caryotype, dans une forme adaptee a leur traduction sous forme de regles utilisables pour un systeme expert. Ces connaissances ont ete utilisees pour le developpement d'un ensemble de methodes d'extraction des caracteristiques chromosomiques et de reconnaissance des chromosomes. Des outils performants de segmentation ont ete concus et mis au point pour permettre de localiser de facon fiable les chromosomes et les extraire du fond metaphasique. Les procedures de reconnaissance de forme developpees incluent des methodes structurelles, statistiques et hierarchiques pour la classification des chromosomes. Une evaluation systematique des performances montre que les outils developpes se comparent tres favorablement a ceux developpes recemment par d'autres chercheurs