Dynamique moléculaire de l'utéroglobine et du complexe utéroglobine-progestérone

par Dominique Housset

Thèse de doctorat en Physique, matière, rayonnement

Sous la direction de Pierre Becker.

Soutenue en 1990

à l'Université Joseph Fourier (Grenoble) .


  • Résumé

    Les proprietes dynamiques de l'uteroglobine et du complexe uteroglobine-progesterone ont ete etudiees par simulation sur super-calculateur. La dynamique moleculaire et la dynamique harmonique, fondee sur des champs de forces empiriques et l'integration des equations classiques du mouvement (equations de newton) permettent d'acceder aux mouvements, a l'echelle atomique, sur des temps allant de la picoseconde a la nanoseconde. L'utilisation conjointe de ces methodes a permis d'elucider le comportement dynamique de la proteine, notamment les mouvements caracteristiques de la structure tertiaire et quaternaire. L'introduction explicite de molecules d'eau (1500 dans notre etude) semble essentielle pour simuler correctement la proteine. L'effet de modifications locales comme la rupture des ponts disulfures ou la mutation de certains residus a pu etre evalue. Differents sites potentiels d'interaction entre proteine et progesterone ont pu etre mis en evidence. Deux d'entre eux ont ete etudies par dynamique moleculaire. Le site interne peut accueillir le steroide sans grands changements structuraux de l'uteroglobine et permet de corroborer certaines observations experimentales concernant la specificite et le role des ponts disulfures. Le probleme de l'accessibilite du site n'a, par contre, pu etre resolu: les echelles de temps necessaires sont certainement bien superieures a la centaine de picoseconde, et sont donc inaccessibles aus simulations actuelles

  • Titre traduit

    Molecular dynamics of uteroglobin and uteroglobin progesterone complex


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Informations

  • Détails : 4, 167 p., [61] p. d́ill
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  • Bibliothèque : Université Grenoble Alpes (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque et Appui à la Science Ouverte. Bibliothèque universitaire Joseph-Fourier.
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