Etudes d'interactions et de structures moléculaires par RMN : structure d'un antibiotique ionophore, structure de protéines, interaction chloroquine-anticorps, interaction sel-lysozyme lors de la phase préliminaire de la cristallisation

The study of the molecular interactions and structures by NMR : structure of an ionophorous antibiotic, protein structure, chloroquine-antibody interaction, interaction salt-lysozyme at the premium phase of crystallisation

• Auteur / Autrice : Nelly Morellet
• Direction : Jean-Claude Beloeil
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance en 1989
• Etablissement(s) : Paris 11
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université de Paris-Sud. Faculté des sciences d'Orsay (Essonne)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Cytochromes

Ionophores

Chloroquine

Protéines

Cristallisation

Résonance magnétique nucléaire

Mots clés libres

Nigéricine

Résumé

Ce travail concerne l'étude de l'applicabilité d'expériences de RMN à deux dimensions (COSY, NOESY, ROESY, TOCSY), à la détermination de la structure spatiale de molécules de taille intermédiaire et de macromolécules biologiques, ainsi qu'à la mise en évidence de processus d'interaction. Dans le cas de l'antibiotique ionophore "nigéricine", l'effet Overhauser nucléaire (NOE) dans le repère du laboratoire est très faible interdisant toute étude classique. Nous avons contourné la difficulté en utilisant l'effet Overhauser dans le repère tournant, qui nous a permis d'accéder à la conformation en solution des sels de sodium et de potassium de cette molécule. La position de l’hème dans la forme paramagnétique du cytochrome b₂ extrait de la levure hansenula anomala a été déterminée. Dans le cadre d'une étude de l'interaction de la ribonucléase (barnase) provenant d’amyloliquefaciens, avec son inhibiteur (barstar), nous avons mis en évidence des éléments de structure secondaire de la barstar (90 acides aminés). Nous avons montré que le type d'interaction entre la chloroquine (petite molécule) et son anticorps spécifique (grosse protéine) est du type aromatique-aromatique. Une application nouvelle de la RMN a été développée : l'étude de l'interaction cation­protéine lors de la phase préliminaire de la cristallisation de celle-ci.