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Thèse soutenue

Logiciels infographiques de modelisation moleculaire : application a l'etude statique et dynamique d'un recepteur macrocyclique

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Auteur / Autrice : Jean-Marie Wurtz
Direction : Georges Wipff
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Physique
Date : Soutenance en 1988
Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Résumé

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Realisation de deux logiciels infographiques de modelisation moleculaire : 2d3d et mdnm, ecrits pour le systeme ps300 couple a un ordinateur vax. Avec 2d3d, construction de structures tridimensionnelles (3d) a partir du dessin interactif 2d, incorporant des contraintes structurales, afin de representer des structures 3d avec ou sans leur surface moleculaire. Emploi de mdnm pour representer les structures dynamiques issues de simulations par la methode de la dynamique moleculaire ou par la methode de monte carlo afin de visualiser de facon statique (par des vecteurs) ou dynamique des modes normaux de vibrations. Application a l'etude d'un recepteur macrotricyclique de synthese, le cryptand sc24 (neutre ou protone) et de divers cryptates de cations et d'anions en combinant 2d3d et mdnm pour des optimisations de mecanique moleculaires, des calculs de modes normaux de vibration, des simulations de dynamique moleculaire