Recherche Avancée

Thèse soutenue

Analyse informatisee des images de gels d'electrophorese bidimensionnelle : conception et mise en oeuvre d'un outil logiciel integre de depouillement et comparaison des images, et d'analyse des donnees

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Auteur / Autrice : Pierre Vincens
Direction : Philippe Tarroux
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
Date : Soutenance en 1986
Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

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Cette etude a consiste dans le developpement d'un systeme complet d'analyse de gels. Des criteres assurant une optimisation de la digitalisation sont definis. En outre, une analyse structurelle des images est presentee. Le debruitage et l'amelioration de la lisibilite de l'image sont realises par divers traitements dont certains fondes sur des techniques de morphologie mathematiques. Toutefois, l'information importante reside dans les variations des intensites des taches dans chaque serie de gels. Un appariement doit donc etre realise. Une technique de description de ''patterns'' combinee a une approche inspiree des systemes experts est employee. La grande quantite d'information collectee suppose une organisation rigoureuse de celle-ci. Le modele relationnel sort de support a cette structuration de la connaissance. Des exemples de requetes correspondant aux formes d'interrogations les plus frequentes sont presentes. Des outils complementaires permettent le controle de la reproductibilite des gels ainsi que la comparaison globale des electrophoreses. Cette approche est completee par une analyse statistique permettant une mise en evidence des polypeptides verifiant certaines conditions. De plus, une etude multivariante est menee, permettant la constitution d'une carte fonctionnelle. Une methode d'apprentissage permet d'effectuer la recherche d'evenements particuliers sur le gel, comme des trainees de glycosylations. Diverses applications de ce systeme sont decrites