Pierre Pontarotti
Pierre Pontarotti a dirigé les 10 thèses suivantes :
Les DDEs transposons à l’origine de l’innovation génétique : exemple du transposon RAG
par Louis Tsakou Ngouafo sous la direction de Pierre Pontarotti - Aix-Marseille
Biologie santé. Maladies infectieuses
Soutenue le 30-06-2022
Modèles et algorithmes pour l'évolution biologique
par Olivier Chabrol sous la direction de Gilles Didier et de Pierre Pontarotti . - Aix-Marseille
Informatique
Soutenue le 14-12-2017
Comparative genomic study for identifying gene acquisitions in Megavirales
par Sourabh Jain sous la direction de Pierre Pontarotti et de Didier Raoult . - Aix-Marseille
Biologie.Génomique et bioinformatique
Soutenue le 06-07-2017
Le défi évolutif du changement climatique, processus adaptatifs chez le corail rouge (Corallium rubrum)
par Marine Pratlong sous la direction de Didier Aurelle et de Pierre Pontarotti . - Aix-Marseille
Océanographie
Soutenue le 05-12-2016
Evolution génomique chez les bactéries du super phylum Planctomycetes-Verrucomicrobiae-Chlamydia
par Sandrine Pinos sous la direction de Didier Raoult et de Pierre Pontarotti . - Aix-Marseille
Biologie. Génomique et bioinformatique
Soutenue le 15-01-2016
L'analyse de données génomiques et l'annotation à l'heure des NGS : la bioinformatique 2.0
par Julien Paganini sous la direction de Pierre Pontarotti - Aix-Marseille
Biologie génomique et bioinformatique
Soutenue le 15-12-2015
Approaches to detect and classify Megavirales
par Vikas Sharma sous la direction de Didier Raoult et de Pierre Pontarotti . - Aix-Marseille
Pathologie humaine. Maladies infectieuses
Soutenue le 23-10-2015
Transfert latéral de séquence
par Thi Phuong Le sous la direction de Pierre Pontarotti et de Didier Raoult . - Aix-Marseille
Biologie. Bioinformatique et génomique
Soutenue le 14-03-2013
Étude du processus de perte de gènes et de pseudogénisation. Intégration et informatisation des concepts de l’évolution biologique. Application à la lignée humaine depuis l'origine des Eucaryotes
par Jacques Dainat sous la direction de Pierre Pontarotti et de Philippe Gouret . - Aix-Marseille
Génomique et Bioinformatique
Soutenue le 16-10-2012
Phylogénomique des bactéries pathogènes
par Kalliopi Georgiades sous la direction de Didier Raoult et de Pierre Pontarotti . - Aix-Marseille 2
Pathologie Humaine
Soutenue le 08-09-2011
Pierre Pontarotti a été président de jury des 3 thèses suivantes :
Les virophages et leurs virus géants
par Saïd Mougari sous la direction de Bernard La Scola - Aix-Marseille
Maladies infectieuses
Soutenue le 22-11-2019
Analyse du génome et du pan-génome pour classifier les bactéries émergentes
par Aurélia Caputo sous la direction de Didier Raoult - Aix-Marseille
Biologie.Génomique et bioinformatique
Soutenue le 23-11-2017
Caractérisation de nouveaux gènes et polymorphismes potentiellement impliqués dans les interactions hôtes-pathogènes
par Charbel Abou-Khater sous la direction de Daniel Olive et de Laurent Abi-Rached . - Aix-Marseille
Biologie. Microbiologie
Soutenue le 05-07-2017
Pierre Pontarotti a été rapporteur des 4 thèses suivantes :
Etude épigénomique sur la domestication du cheval à l'aide d'ADN ancien
par Marine Poullet sous la direction de Ludovic Orlando - Toulouse 3
Anthropobiologie
Soutenue le 09-03-2022
Etude évolutive multi-niveaux des gènes de la multiciliation chez les métazoaires
par Audrey Defosset sous la direction de Odile Lecompte et de Olivier Poch . - Strasbourg
Bioinformatique
Soutenue le 11-09-2020
Phylogeny and evolution of a highly diversified catfish subfamily : the Loricariinae (Siluriformes, Loricariidae)
par Raphaël Covain sous la direction de Stéphane Dray , Denis Duboule et de Sonia Fisch-Muller . - Lyon 1
Évolution et biodiversité
Soutenue le 15-09-2011
L’évolution modulaire des protéines : un point de vue phylogénétique
par Anne-Sophie Sertier sous la direction de Vincent Daubin et de Daniel Kahn . - Lyon 1
Bio-informatique
Soutenue le 12-09-2011
Pierre Pontarotti a été membre de jury des 4 thèses suivantes :
Contribution des éléments transposables à l’adaptabilité de ravageurs de cultures en absence de reproduction sexuée
par Djampa Kozlowski sous la direction de Etienne Gaëtan Jacques Danchin - Université Côte d'Azur
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 13-11-2020
Apport de la phylogénomique pour l’étude des interactions moléculaires entre Henipavirus et leurs réservoirs : les chauves-souris du genre Pteropus
par Julien Fouret sous la direction de Branka Horvat et de Catherine Legras . - Lyon
Sciences de la Vie
Soutenue le 14-12-2018
Etude d'un système d'équations différentielles stochastiques : Le cliquet de Muller
par Julien Audiffren sous la direction de Etienne Pardoux - Aix-Marseille 1
Mathématiques
Soutenue le 16-12-2011
Coalescent, recombinaisons et mutations
par Majid Salamat sous la direction de Etienne Pardoux et de Bijan Z. Zangeneh . - Aix-Marseille 1
Mathématiques
Soutenue le 14-03-2011
