, mélanome de la choroïde  ADN -- Réplication  ADN  ARNs non-Codant régulateurs  Algorithmes  Alignement de séquences  Analyse  Analyse de données  Analyse de séquence de protéine  Analyse en composantes indépendantes  Analyse multivariée  Analyse stochastique  Aspect génétique  Atlas  Bases de données  Bioinformatique  Biologie computationelle  Biologie des systèmes  Biomathématiques  Biostatistiques  CRISPR/Cas9  CTCF  Cancer  Cancer du sein  Cancer du sein triple négatif  Carcinogenèse  Cellule souche embryonnaire  Cellules souches embryonnaires  ChIP-seq  Chimiothérapie néoadjuvante  Chromatine  Clones  Expression génique  Génome humain  Génomique  Épigénétique  

Emmanuel Barillot a rédigé les 2 thèses suivantes :

Structures de Turing dans les systèmes chlorite-iodure-acide malonique et dioxyde de chlore-iode-acide malonique : études théoriques et modélisation numérique

par Emmanuel Barillot sous la direction de Jacques Boissonade - Bordeaux 1

Chimie - Physique

Soutenue en 1996

Cartographie physique du génome humain

par Emmanuel Barillot sous la direction de Daniel Cohen - Châtenay-Malabry, Ecole centrale de Paris

Biophysique moléculaire

Soutenue en 1992

Emmanuel Barillot a dirigé les 7 thèses suivantes :

Conserved function of the long non-coding RNA PVT1 in vertebrate development

par Florian Constanty sous la direction de Alena Shkumatava et de Emmanuel Barillot . - Université Paris sciences et lettres

Biologie moléculaire et cellulaire

Soutenue le 04-11-2022

De la modélisation mécanistique des voies de signalisation dans le cancer à l’interprétation des modèles et de leurs apports : applications cliniques et évaluation statistique

par Jonas Béal sous la direction de Emmanuel Barillot et de Aurélien Latouche . - Université Paris sciences et lettres

Génomique

Soutenue le 23-09-2020

Zebrafish as a model to determine conserved gene regulatory mechanisms in vertebrates

par Yuvia Alhelí Pérez Rico sous la direction de Emmanuel Barillot et de Alena Shkumatava . - Sorbonne université

Génomique

Soutenue le 11-12-2018

Analyses bioinformatiques de la régulation des éléments transposables chez les mammifères

par Aurélie Teissandier sous la direction de Déborah Bourc'his et de Emmanuel Barillot . - Sorbonne université

Bioinformatique

Soutenue le 05-10-2018

Analysis of chromosome conformation data and application to cancer

par Nicolas Servant sous la direction de Emmanuel Barillot et de Edith Heard . - Paris 6

Complexité du vivant

Soutenue le 22-11-2017

Comprehensive Molecular and Clinical Characterization of Retinoblastoma

par Meriem Sefta sous la direction de François Radvanyi et de Emmanuel Barillot . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Soutenue le 02-11-2015

Méthodes à noyau pour l'annotation automatique et la prédiction d'interaction de structures de protéine

par Martial Hue sous la direction de Emmanuel Barillot et de Jean-Philippe Vert . - Paris 7

Analyse de génomes et modélisation moléculaire

Soutenue en 2011

Emmanuel Barillot a été président de jury de la thèse suivante :

Étude de l’hétérogénéité cellulaire et des dynamiques de régénération de l’épithélium respiratoire sain par analyses des signatures transcriptionnelles sur cellules uniques

par Marie Deprez sous la direction de Pascal Barbry et de Michel Barlaud . - Université Côte d'Azur (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 12-12-2019

Emmanuel Barillot a été membre de jury des 6 thèses suivantes :

Pharmacogenomic and High-Throughput Data Analysis to Overcome Triple Negative Breast Cancers Drug Resistance

par Benjamin Sadacca sous la direction de Fabien Reyal - Université Paris-Saclay (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 15-12-2017

Analyse intégrative de données génomiques et pharmacologiques pour une meilleure prédiction de la réponse aux médicaments anti-cancer

par Yu Fu sous la direction de Fabrice André et de Céline Lefebvre . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Soutenue le 19-12-2016

Reconstruction of gene regulatory networks defining the cell fate transition processes

par Valeriya Malysheva sous la direction de Hinrich Gronemeyer - Strasbourg

Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie

Soutenue le 10-11-2016

Cell-based multi-scale modeling for systems and synthetic biology : from stochastic gene expression in single cells to spatially organized cell populations

par François Bertaux sous la direction de Grégory Batt et de Dirk Drasdo . - Paris 6

Mathématiques

Soutenue le 15-05-2016

Plasticité du programme spatio-temporel de réplication au cours du développement et de la différenciation cellulaire

par Hanna Julienne sous la direction de Alain Arnéodo - Lyon, École normale supérieure

Physique

Soutenue le 11-12-2013

Caractérisation de marqueurs moléculaires associés à un haut risque de développement de métastases chez des patients atteints du mélanome de la choroïde

par Cecile Laurent sous la direction de Simon Saule - Paris 11

Bioinformatique

Soutenue le 26-09-2011