Adjacence  Algorithmes  Algorithmes d'approximation  Algorithmes génétiques  Algorithmes paramétrés  Algorithmique  Algorithmique des graphes  Arbres  Bioinformatique  Bootstrap  Chromosomes  Combinatoire  Complexité calculatoire  Complexité de calcul  Complexité paramétrique  Coévolution  Cycle orienté  Double cut and join  Duplications de gènes  Décomposition de la permutation en transpositions  Graphe orienté  Graphes orientés  Graphes, Théorie des  Génome  Génomique  Informatique  L'évolution du génome  Modèle  Méthodes de consensus  Optimisation combinatoire  Pertes de gènes  Phylogénie  Probabilités  Programmation dynamique  Quadrangulation de poids minimum  Réarrangement génétique  

Vincent Berry a rédigé la thèse suivante :

Méthodes et algorithmes pour reconstruire les arbres de l'Evolution

par Vincent Berry sous la direction de Olivier Gascuel - Montpellier 2

Mathématiques appliquées

Soutenue en 1997

Vincent Berry a dirigé les 3 thèses suivantes :

Réconciliations : corriger des arbres de gènes et inférer la fiabilité d'événements évolutifs

par Hau Nguyen Thi sous la direction de Vincent Ranwez et de Vincent Berry . - Montpellier 2

Informatique

Soutenue le 03-10-2013

Méthodes combinatoires de reconstruction de réseaux phylogénétiques

par Philippe Gambette sous la direction de Christophe Paul et de Vincent Berry . - Montpellier 2

Informatique

Soutenue le 30-11-2010

Approches combinatoires pour le consensus d'arbres et de séquences

par Sylvain Guillemot sous la direction de Olivier Gascuel et de Vincent Berry . - Montpellier 2

Informatique

Soutenue en 2008

Vincent Berry a été président de jury des 3 thèses suivantes :

Weighted Genome Rearrangements

par Pijus Simonaitis sous la direction de Annie Chateau et de Krister Swenson . - Montpellier

Informatique

Soutenue le 10-07-2020

Algorithmic and structural results on directed cycles in dense digraphs

par Jocelyn Thiebaut sous la direction de Stéphane Bessy - Montpellier

Informatique

Soutenue le 19-11-2019

Treewidth : algorithmic, combinatorial, and practical aspects

par Julien Baste sous la direction de Dimitrios M. Thilikos et de Ignasi Sau Valls . - Montpellier

Informatique

Soutenue le 22-09-2017

Vincent Berry a été rapporteur des 2 thèses suivantes :

Phylogénie des dépendances et dépendances des phylogénies dans les gènes et les génomes

par Wandrille Duchemin sous la direction de Eric Tannier et de Vincent Daubin . - Lyon

Biologie

Soutenue le 04-12-2017

Évolution de l’architecture des génomes : modélisation et reconstruction phylogénétique

par Magali Semeria sous la direction de Eric Tannier et de Laurent Guéguen . - Lyon 1

Génomique évolutive

Soutenue le 09-12-2015