Cristina Vieira-Heddi
Cristina Vieira-Heddi a rédigé la thèse suivante :
Comportement de rétrotransposons (copia, mdg1, gypsy et 412) dans les populations de Drosophila melanogaster et D. Simulans
par Cristina Vieira-Heddi sous la direction de Christian Biémont - Lyon 1
Sciences
Soutenue en 1996
Cristina Vieira-Heddi a dirigé les 12 thèses suivantes :
Caractérisation de la réponse au stress chez une espèce invasive Drosophila suzukii
par Pierre Marin sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Patricia Gibert . - Lyon
Sciences biologiques
Soutenue le 11-06-2020
Dérégulation des gènes et éléments transposables entre sous-espèces de Drosophila mojavensis et D. arizonae
par Cecilia Artico Banho sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Claudia marcia aparecida Carareto . - Lyon
Biomath-Bioinfo-Génomique évolutive
Soutenue le 13-05-2020
Analyses et méthodes pour les données transcriptomiques issues d’espèces non modèles : variation de l’expression des éléments transposables (et des gènes) et variants nucléotidiques
par Hélène Lopez-Maestre sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Vincent Lacroix . - Lyon
Bio-informatique
Soutenue le 15-02-2017
Bases génétiques de l’adaptation du moustique tigre Aedes albopictus à de nouveaux environnements : une approche sans à priori reposant sur les éléments transposables
par Clément Goubert sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Matthieu Boulesteix . - Lyon 1
Biologie évolutive
Soutenue le 04-12-2015
Activité d'éléments transposables dans les populations de Drosophila mojavensis et D. arizonae et chez leurs hybrides
par Elias Alberto Gutierrez Carnelossi sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Claudia marcia aparecida Carareto . - Lyon 1
Génétique et génomique évolutive
Soutenue le 07-03-2014
Régulation épigénétique d’un rétrovirus endogène, tirant, dans la lignée germinale de la drosophile
par Abdou Akkouche sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Marie Fablet . - Lyon 1
Biologie
Soutenue le 13-04-2012
Étude de l’influence des éléments transposables sur la régulation des gènes chez les mammifères
par Hussein Mortada sous la direction de Emmanuelle Lerat et de Cristina Vieira-Heddi . - Lyon 1
Biologie
Soutenue le 04-10-2011
Helena chez la Drosophila
par Adriana Granzotto sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Claudia marcia aparecida Carareto . - Lyon 1
Génomique des populations
Soutenue le 16-02-2011
La régulation épigénétique des éléments transposables dans les populations naturelles de Drosophila simulans
par Benjamin Hubert sous la direction de Cristina Vieira-Heddi - Lyon 1
Évolution Écosystèmes, Microbiologie, Modélisation
Soutenue le 17-12-2010
TE variation in natural populations of Drosophila : copy number, transcription and chromatin state
par Rita Rebollo Figueiredo Da Silva sous la direction de Cristina Vieira-Heddi - Lyon 1
Sciences de la vie
Soutenue le 26-10-2009
Étude de l’expression des éléments transposables chez drosophila melanogaster par approche bioinformatique
par Marc Deloger sous la direction de Cristina Vieira-Heddi et de Marie-France Sagot . - Lyon 1
Bioinformatique
Soutenue le 25-09-2009
L'élément tirant chez Drosophila simulans : invasion des populations ou disparition ?
par Marie Fablet sous la direction de Cristina Vieira-Heddi - Lyon 1
Génomique des populations
Soutenue en 2006
Cristina Vieira-Heddi a été président de jury des 19 thèses suivantes :
Développement de méthodes bio-informatiques pour l’étude de l’épissage chez les espèces non modèles : épissage complexe et apport des technologies de séquençage de 3eme génération
par Camille Sessegolo sous la direction de Vincent Lacroix , Arnaud Mary et de Jean-Marc Aury . - Lyon
Bioinformatique
Soutenue le 22-10-2021
Contrôle épigénétique du transcriptome ovarien chez Drosophila melanogaster
par Daniela Torres campana sous la direction de Benjamin Loppin et de Guillermo A. Orsi . - Lyon
Génétique
Soutenue le 28-09-2021
Identification of key players in the gut microbiota based on a unified reference for a standardized quantitative metagenomics and metabolic analysis framework
par Marianne Borderes sous la direction de Marie-France Sagot et de Susana Vinga . - Lyon
Bioinformatique
Soutenue le 06-07-2021
Impact des éléments transposables sur l'évolution de la régulation des gènes : exemple du sexe chez les poissons téléostéens
par Corentin Dechaud sous la direction de Jean-Nicolas Volff - Lyon
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 18-05-2021
Etude intégrative des conséquences de la lumière artificielle nocturne chez le crapaud commun, Bufo bufo : effets moléculaires, physiologiques et comportementaux
par Morgane Touzot sous la direction de Claude Duchamp et de Nathalie Mondy . - Lyon
Ecophysiologie
Soutenue le 16-12-2020
Development of new algorithms to advance on the discovery of microRNAs
par Carol Moraga Quinteros sous la direction de Marie-France Sagot et de Rodrigo A. Gutiérrez . - Lyon
Bioinformatique
Soutenue le 03-11-2020
Biais de composition nucléotidique des gènes et épissage alternatif
par Sébastien Lemaire sous la direction de Didier Auboeuf - Lyon
Biologie
Soutenue le 15-03-2019
Rétrovirus endogènes humains et réponse immunitaire de l’hôte suite à une agression inflammatoire
par Olivier Tabone sous la direction de Julien Textoris et de François Mallet . - Lyon
Bioinformatique
Soutenue le 31-01-2019
Approches in silico de l'impact des éléments transposables sur la régulation de l'expression des gènes.
par Ophélie Jouffroy sous la direction de Florian Maumus et de Hadi Quesneville . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Biologie moléculaire et cellulaire
Soutenue le 14-12-2018
Analyse de l’épissage alternatif dans les données RNAseq : développement et comparaison d’outils bioinformatiques
par Clara Benoit-Pilven sous la direction de Didier Auboeuf - Lyon
Bioinformatique
Soutenue le 15-12-2016
Diversité génétique et admixture au sein du complexe d’espèces Bemisia tabaci : contributions des compartiments nucléaires et cytoplasmiques
par Gabriel Terraz sous la direction de Frédéric Fleury et de Laurence Mouton . - Lyon
Biologie
Soutenue le 06-07-2016
Fonctions des thiorédoxines sexuelles et contrôle de l’état rédox des protamines chez la drosophile
par Samantha Tirmarche sous la direction de Benjamin Loppin - Lyon
Biologie
Soutenue le 23-06-2016
Implication de la niche écologique et des indices environnementaux liés à la localisation de la ressource dans le succès invasif du ravageur Drosophila suzukii : des pistes pour le développement du piégeage massif
par Christophe Plantamp sous la direction de Patricia Gibert et de Emmanuel Desouhant . - Lyon
Écologie et biologie de l’invasion
Soutenue le 13-05-2016
Écologie du microbiote bactérien associé au moustique tigre Aedes albopictus : une approche "omique" pour l'exploration de l'holobionte vecteur
par Guillaume Minard sous la direction de Claire Valiente Moro et de Patrick Mavingui . - Lyon 1
Microorganismes, interactions, infections
Soutenue le 15-12-2014
Réplication, condensation et division des chromosomes parentaux dans le zygote de drosophile
par Laetitia Delabaere sous la direction de Benjamin Loppin - Lyon 1
Génétique
Soutenue le 08-12-2014
Évolution des génomes des endosymbiotes chez les insectes phloémophages : le cas d'Hamiltonella defensa en interaction avec ses différents partenaires
par Pierre-Antoine Rollat-Farnier sous la direction de Marie-France Sagot , Laurence Mouton et de Fabrice Vavre . - Lyon 1
Physiologie et biologie des organismes - populations - interactions
Soutenue le 24-11-2014
Comparative genomics of transposable element evolution and their evolutionary impacts in fish and other vertebrate genomes
par Domitille Chalopin sous la direction de Jean-Nicolas Volff - Lyon, École normale supérieure
Sciences de la Vie
Soutenue le 23-05-2014
Comment le X vient-il à la rescousse du Y ? : évolution de la compensation de dosage des XY humains et autres questions sur l'évolution des chromosomes sexuels eucaryotes
par Eugénie Pessia sous la direction de Gabriel Marais - Lyon 1
Biologie
Soutenue le 12-12-2013
Organisation et intégrité des chromosomes parentaux à la fécondation chez la drosophile
par Guillaume Orsi sous la direction de Benjamin Loppin et de Pierre Couble . - Lyon 1
Génétique, biologie moléculaire et cellulaire
Soutenue le 27-04-2011
Cristina Vieira-Heddi a été rapporteur des 7 thèses suivantes :
Approches in silico de l'impact des éléments transposables sur la régulation de l'expression des gènes.
par Ophélie Jouffroy sous la direction de Florian Maumus et de Hadi Quesneville . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Biologie moléculaire et cellulaire
Soutenue le 14-12-2018
Plasticité des génomes des pucerons des céréales et de leur plante hôte : recherche in silico et in vitro des éléments transposables des superfamilles Tc1-mariner-IS630 et piggyBac
par Maryem Bouallègue sous la direction de Pierre Capy et de Mohamed Makni . - Université Paris-Saclay (ComUE)
Sciences de la vie et de la santé
Soutenue le 27-03-2017
L'influence du contexte génomique sur la sélection du site d'intégration par les rétrotransposons humains L1
par Tania Sultana sous la direction de Gaël Cristofari - Université Côte d'Azur (ComUE)
Interactions moléculaires et cellulaires
Soutenue le 12-12-2016
Etude de l'activité transpositionnelle en condition de stress chez le riz, Oryza sativa
par Emilie Debladis sous la direction de Olivier Panaud et de Eric Lasserre . - Perpignan
Biologie
Soutenue le 25-11-2016
Structures et Fonctions des séquences subtélomériques productrices de piRNA
par Amna Asif-Laidin sous la direction de Laure Teysset - Paris 6
Génétique
Soutenue le 04-04-2016
Génomique comparative et évolutive au sein du complexe d’espèces Leptosphaeria maculans-Leptosphaeria biglobosa
par Jonathan Grandaubert sous la direction de Thierry Rouxel - Paris 11
Biologie
Soutenue le 22-10-2013
Étude de la variabilité phénotypique, sous influence environnementale, chez Schistosoma mansoni, parasite de l'homme : implication de l'épigénome par une approche globale
par Julie M. J. Lepesant sous la direction de Christoph Grunau - Perpignan
Biologie
Soutenue en 2012
Cristina Vieira-Heddi a été membre de jury des 3 thèses suivantes :
Enumeration Algorithms and Graph Theoretical Models to Address Biological Problems Related To Symbiosis
par Mattia Gastaldello sous la direction de Marie-France Sagot et de Tiziana Calamoneri . - Lyon
Bioinformatique
Soutenue le 16-02-2018
La conversion génique biaisée : origine, dynamique et intensité de la quatrième force d’évolution des génomes eucaryotes
par Yann Lesecque sous la direction de Laurent Duret - Lyon 1
Génomique évolutive
Soutenue le 11-07-2014
Etude in vivo et in vitro du rétrovirus endogène gypsy chez Drosophila melanogaster
par Franck Touret sous la direction de Christophe Terzian - Paris, EPHE
Systèmes intégrés, environnement, biodiversité
Soutenue en 2014
