Phospholipases, un regard biophysique : analyse de l'effet de la composition lipidique dans des systèmes membranaires modèles sur l'activité de PLA1-1, une phospholipase cytosolique dépendante du calcium d'Aspergillus orizae

par Giacomo Corux (Corucci)

Projet de thèse en Physique appliquee

Sous la direction de Giovanna Fragneto et de Krishna Batchu.

Thèses en préparation à l'Université Grenoble Alpes , dans le cadre de École doctorale physique , en partenariat avec Institut LAUE LANGEVIN (laboratoire) depuis le 04-11-2019 .


  • Résumé

    Ce projet tentera de donner de nouvelles informations sur la complexité des interactions sous-jacentes des glycérophospholipides (GPL) et de la phospholipase PLA1-1, dans une relation complexe. L'enzyme PLA1-1 est une étude percutante, car on pense qu'elle joue un rôle clé dans divers processus cellulaires tels que le remodelage de la membrane et l'homéostasie GPL. Dans cette étude, nous proposons d'utiliser la réflectométrie neutronique et des techniques de surface complémentaires pour étudier l'interaction de bicouches lipidiques planaires formées par des lipides de longueurs de chaîne et de degrés d'insaturation variables avec PLA1-1, permettant ainsi de mieux comprendre les dimensions moléculaires de le site actif catalytique de l'enzyme, en plus d'autres facteurs clés qui pourraient réguler la spécificité de son substrat. Ainsi, la compréhension de ces phénomènes facilitera les études (simulations de dynamique moléculaire / amarrage moléculaire) visant à concevoir de nouveaux médicaments / inhibiteurs ciblant l'enzyme.

  • Titre traduit

    Phospholipases, a biophysical view: analysis of the effect of lipid composition in model membrane systems on the activity of PLA1-1, an Aspergillus orizae calcium dependent cytosolic phospholipases


  • Résumé

    This project shall attempt to open new insights into the complexities underlying how glycerophospholipids (GPL) and the mitochondria-localized phospholipase, PLA1-1 interact in a complex relationship. The enzyme, PLA1-1 makes an impactful study since it is thought to play a key role in various cellular processes that include membrane remodelling and GPL homeostasis. In this study, we propose to use neutron reflectometry and complementary surface techniques to study the interaction of planar lipid bilayers formed by lipids of varying chain lengths and degree of unsaturation with PLA1-1 thereby allowing us to shed light on the molecular dimensions of the catalytic active site of the enzyme in addition to other key factors that could regulate its substrate specificity. Thus unraveling these phenomena shall assist in studies (Molecular Dynamic simulations/molecular docking) attempting to design novel drugs/inhibitors targeting the enzyme.