Mécanismes d’inhibition de la traduction contexte-dépendants par des antibiotiques ciblant le ribosome bactérien

Mechanisms of context-dependent translation inhibition by ribosome-targeting antibiotics

• Auteur / Autrice : Élodie Leroy
• Direction : Axel Innis
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie - immunologie
• Date : Soutenance le 22/11/2021
• Etablissement(s) : Bordeaux
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Bordeaux)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : MicroR³ - Microbial RNAs, Ribosomes and Regulation
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Acides Nucléiques : Régulations Naturelle et Artificielle
• Jury : Président / Présidente : Éric Ennifar
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Axel Innis, Éric Ennifar, Scott Blanchard, Suparna Sanyal, Fabien Darfeuille
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Éric Ennifar, Scott Blanchard

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bactéries pathogènes

Site d'entrée interne des ribosomes

Résistance aux antibiotiques

Maladies infectieuses

Antibiotiques

Mots clés libres

Ribosome

Bactéries pathogènes

Antibiotiques

Traduction

Antibiorésistance

Maladies infectieuses

Ribosome

Bacterial pathogens

Antibiotics

Translation

Antibiotic resistance

Infectious diseases

Résumé

Les bactéries sont présentes partout dans notre environnement et sont indispensables à notre bon fonctionnement. Malheureusement, certaines d'entre elles provoquent également des maladies infectieuses, que nous traitons avec des antibiotiques. Dans certains cas, les bactéries pathogènes sont capables de survivre à l'exposition à ces antibiotiques, grâce à une série de phénomènes connus collectivement sous le nom de résistance aux antibiotiques. L'utilisation excessive des antibiotiques a accéléré ce processus, qui est aujourd'hui l'une des menaces les plus graves pour la santé publique. Mon travail de thèse porte sur les antibiotiques qui ciblent le ribosome, la grande usine moléculaire responsable de la production de protéines dans tous les organismes vivants. Plus précisément, j'ai cherché (i) à comprendre le mécanisme par lequel les bactéries deviennent résistantes aux antibiotiques largement utilisés comme l'érythromycine, et (ii) à déterminer le mode d'action moléculaire de plusieurs antibiotiques, dont les antituberculeux de seconde ligne capréomycine et viomycine, et l'antibiotiquetétracénomycine X, plus récent mais très prometteur. Une meilleure compréhension de ces processus pourrait à terme apporter des solutions pour ralentir la propagation de la résistance aux antibiotiques.

Bacteria are present everywhere in our environment and are essential for our proper functioning. Unfortunately, some of them also cause infectious diseases, which we treat with antibiotics. In some cases, pathogenic bacteria are able to survive exposure to these antibiotics,through a series of phenomena collectively known as antibiotic resistance. The misuse of antibiotics has accelerated this process, which is now one of the most serious threats to global health. My thesis work focuses on antibiotics that target the ribosome, the large molecular factory responsible for producing proteins in all living organisms. Specifically, I have sought (i) to understand the mechanism by which bacteria become resistant to widely used antibiotics like erythromycin, and (ii) to determine the molecular mode of action of several antibiotics, including the second line antituberculosis drugs capreomycin and viomycin, and the more recent but very promising antibiotic tetracenomycin X. A better understanding of these processes could ultimately provide solutions to slow the spread of antibiotic resistance.