Thèse soutenue

Rôle de la protéine virale PA-X dans la pathologie des virus influenza aviaires faiblement pathogènes
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Auteur / Autrice : Léa Meyer
Direction : Ronan Le Goffic
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé
Date : Soutenance le 20/11/2017
Etablissement(s) : Sorbonne Paris Cité
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Bio Sorbonne Paris Cité (Paris ; 2014-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Virologie et immunologie moléculaire (VIM)
établissement de préparation : Université Paris Diderot - Paris 7
Jury : Président / Présidente : Sylvie Van der Werf
Examinateurs / Examinatrices : Sylvie Van der Werf, Mariette Ducatez, Manuel Rosa-Calatrava, Pascale Massin, Sascha Trapp
Rapporteurs / Rapporteuses : Mariette Ducatez, Manuel Rosa-Calatrava

Résumé

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L’objectif de ce travail de thèse a été de caractériser les mécanismes d’action de virus influenza A faiblement pathogène chez le poulet. Ce travail s’articule autour de deux axes : la caractérisation de la réponse à l’infection d’une lignée épithéliale pulmonaire de poulet (CLEC213) par des virus aviaires faiblement pathogènes et le rôle de la protéine accessoire virales PA-X au cours de l’infection. Dans un premier temps, nous avons mis en évidence par transcriptomique que l’infection virale par deux souches aviaires faiblement pathogènes, en plus d’induire des voies de signalisation cellulaire et de l’immunité innée caractéristiques des virus influenza, induit une signature mitochondriale forte. Les produits de ces gènes sont des protéines impliquées dans la phosphorylation oxydative, la voie métabolique centrale de la respiration cellulaire. Nous avons montré que cette signature transcriptomique s’accompagne d’un effet fonctionnel. La production d’ATP, le produit de la phosphorylation oxydative, est augmentée en présence du virus dès les premières heures de l’infection. Nous avons dosé le virus en présence de drogue bloquant la phosphorylation oxydative en conditions viables pour la cellule et montré que la réplication efficace du virus s’appuie sur une respiration cellulaire fonctionnelle. Dans un second temps, nous avons choisi d’étudier l’effet de la protéine virale nouvellement décrite PA-X sur l’infection des CLEC213. Nous avons généré un virus recombinant incapable de synthétiser PA-X et comparé l’infection des CLEC213 par les virus sauvage et mutant à l’aide de l’outil transcriptomique. Cette analyse met en évidence un effet important de PA-X sur les voies métaboliques de la cellule tel que la glycolyse, la gluconéogenèse, la dégradation du pyruvate en lactate, ainsi que des gènes associés au fonctionnement de la mitochondrie. Ainsi, PA-X pourrait être impliquée dans la reprogrammation métabolique des cellules infectées