Impact des fluoroquinolones sur la résistance bactérienne dans les microbiotes humains

= Impact of fluoroquinolones on bacterial resistance in human microbiota

• Auteur / Autrice : Victoire de Lastours
• Direction : Bruno Fantin, Raymond Ruimy
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : [Biologie cellulaire]
• Date : Soutenance en 2014
• Etablissement(s) : Paris 7

Mots clés

Mots clés contrôlés

Métagénome

Résistance bactérienne aux médicaments

Fluoroquinolones

Résumé

Les fluoroquinolones (FQ) sont des antibiotiques parmi les plus prescrits au monde. L'augmentation importante des prescriptions de FQ est accompagnée de l'émergence inquiétante de la résistance bactérienne responsable d'échecs cliniques et d'émergence de bactéries multi-résistantes. Les FQ diffusent très bien dans les écosystèmes, expliquant leur impact particulier au niveau des microbiotes. Or, les microbiotes humains constituent un réservoir majeur de la résistance bactérienne. Dans un premier volet épidémiologique, nous avons déterminé la prévalence du portage de résistance aux FQ dans les différents microbiotes de patients hospitalisés ainsi que les taux d'émergence de résistance chez des patients traités par FQ. Nous avons montré que chaque microbiote se comportait de façon indépendante en termes de facteurs de risque de portage de souches résistantes, comme d'émergence de la résistance sous traitement. Dans une seconde partie, nous avons montré dans le microbiote nasal et intestinal, que l'émergence de la résistance aux quinolones était un phénomène fréquent aux dynamiques variables, essentiellement dû à l'acquisition de souches résistantes exogènes. Enfin, nous avons montré que les souches résistantes pouvaient persister dans le tube digestif, parce qu'elles étaient particulièrement bien adaptées au commensalisme, leur conférant un avantage sélectif. Ceci expliquerait les taux importants de colonisation par des souches de Escherichia coli résistantes aux quinolones dans le microbiote intestinal chez l'homme avec la double conséquence d'augmenter les risques de transmission interindividuelle et les risques d'infections par ces souches résistantes.