Vers une utilisation optimale du génotypage et des scores de gravité dans la prise en charge de la drépanocytose

Towards an optimal use of genotyping and of severity scores in the medical follow-up of sickle-cell disease

• Auteur / Autrice : Philippe Joly
• Direction : Cyril Martin, Alain Francina
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Recherche clinique
• Date : Soutenance le 13/12/2012
• Etablissement(s) : Lyon 1
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Interdisciplinaire Sciences-Santé (Villeurbanne ; 1995-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de recherche et d'innovation sur le sport (Villeurbanne, Rhône)
• Jury : Président / Présidente : Jacques Rochette
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Damien Sanlaville
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Frédéric Galacteros, Béatrice Gulbis

Mots clés

Mots clés contrôlés

Opiacés

Mosaïcisme

Diagnostic moléculaire

Pharmacogénétique

Drépanocytose

Mots clés libres

Drépanocytose

Génotypage

Gène modificateur

Score de gravité

Pharmacogénétique

Diagnostic moléculaire

Mosaïcisme

Opiacés

Sickle-cell disease

Genotyping

Modifier gene

Severity score

Pharmacogenetics

Molecular diagnosis

Mosaicism

Opiates

Résumé

Cette thèse cherche à optimiser l’utilisation du génotypage et des scores de gravité dans la drépanocytose. L’aspect diagnostic génétique ne nous semblait pas poser problème jusqu’à ce que nous rencontrions un cas très atypique d’hétérozygotie A/S avec délétion en mosaïque du gène β-globine qui nous a conduits à réfléchir sur une nouvelle forme génétique potentielle de syndrome drépanocytaire majeur. Pour ce qui est des gènes modificateurs de drépanocytose, nous avons voulu faciliter leur l’accès en proposant, pour deux d’entre eux (haplotypes β-globine et G6PD), une méthode de génotypage rapide par HRM et/ou FRET. Notre travail a consisté ensuite en la validation d’un score de sévérité pédiatrique décrit initialement par Van den Tweel. De façon inattendue, les résultats nous ont amenés à nous interroger sur le rôle exact du génotype α-globine dans la drépanocytose avec un possible effet âge-dépendant. Enfin, nous avons étudié les fréquences alléliques des principaux polymorphismes influant sur l’activité des opiacés: une résistance pharmacologique (gènes OPRM1 et COMT) est apparue peu probable mais une proportion non négligeable de drépanocytaires pourrait avoir des génotypes ABCB1 et UGT2B7 défavorables à la biodisponibilité des opiacés

This work is submitted for a PhD thesis in the field of red cell haematology. Sickle cell disease (SCD) is a monogenic disorder under polygenic and environmental control. The aim of this work was to integrate genotyping results from patients' DNA into the determination of the disease severity scores. Through a large population of SCD patients, we have discovered an atypical case of βA / βS heterozygosity namely, a mosaicism deletion of the beta-globin gene. This represents a new SCD complex situation for molecular diagnosis. Further investigations have led to set up a new genotyping method by using HRM and/or FRET for the determination of two SCD modifiers (beta-globin haplotypes and G6PD deficiency). By using a paediatric severity score of the disease proposed by Van den Tweel, our results show that there is a possible age-dependent effect of the alpha-globin gene in the severity of SCD. Finally, we studied the allelic frequencies of the main opiate-related polymorphisms: a pharmacological resistance (OPRM1 and COMT genes) seemed unlikely but a quite important proportion of patients could have both an ABCB1 and a UGT2B7 genotype unfavorable for opiates bioavailability