Caractérisation biochimique et moléculaire de différentes populations de palourdes tunisiennes : rôle de la Leucine Aminopeptidase dans l'adaptation à la salinité

par Aicha Gharbi

Thèse de doctorat en Physiologie et biologie des organismes, populations et interactionsPhysiologie et biologie des organismes, populations et interactions

Sous la direction de Alain Van Wormhoudt et de Khaled Said.

Le président du jury était Daniel Sellos.

Le jury était composé de Hassen Bencheikh.

Les rapporteurs étaient Mohamed Makni, Dario Moraga.


  • Résumé

    L’étude de la diversité et de la structuration génétique populationnelle des organismes marins est une approche principale pour la mise en place de mesures de gestion et de conservation pour les espèces exploitées. L’étude de la variabilité génétique des populations de Ruditapes decussatus, des côtes Nord et côtes Est tunisiennes situées respectivement dans les bassins Ouest et Est de la Méditerranée, est abordée par l’analyse de différents types de marqueurs. L’analyse du polymorphisme de neuf loci allozymiques a montré une nette structuration génétique des populations de R. Decussatus de part et d’autre du détroit Siculo-Tunisien. Cette structuration semble être le reflet de processus historique et contemporain : une intergradation, probablement secondaire, est confirmée par une variation clinale observée pour 60% des loci polymorphes avec un point de rupture qui coïncide avec le détroit S-T, zone d’hybridation entre les deux bassins. L’analyse du polymorphisme du fragment du gène de la COI et de la région ITS1 a confirmé la présence d’une variation clinale au niveau d’un haplotype majoritaire de COI et au niveau de trois parmi les cinq haplotypes majoritaires de ITS1. L’absence de différenciation entre populations sur la base des données des deux marqueurs COI et ITS1 peut être expliquée, du moins en partie, par les fortes fréquences des haplotypes rares qui pourraient traduire les effets d’une expansion démographique récente qui masqueraient une réelle structuration génétique ancienne. La capacité adaptative des palourdes face au facteur salinité a été évaluée par l’étude d’un marqueur enzymatique (Lap-1). Les expérimentations de survie menées en milieux hypo et hyper osmotiques ont montré que la palourde Tunisienne est bien adaptée aux variations de salinité entre 10ppm et 50ppm. Cette capacité adaptative n’est pas liée à la Lap-1 qui s’est révélée hétéromorphe chez la palourde Tunisienne par comparaison à la palourde de Bretagne.

  • Titre traduit

    Biochemical and molecular characterization of Tunisian clam population : role of Leucine aminopeptidase in adaptation to the changes in salinity


  • Résumé

    Knowledge about population diversity and structure is among the most important questions to investigate, especially concerning exploited species. Genetic variability of R. Decussatus populations collected from localities in the eastern and western Mediterranean coasts of Tunisia was examined using different markers. Genetic polymorphism of nine allozyme loci showed a significant clustering of all samples in two main divergent groups on either sides of the Siculo-Tunisian strait. This pattern seems to be the result of historical and contemporary process: a plausible model of secondary intergradation is supported by the observation of coincident clines at nearly 60% of the polymorphic loci that were centered at the Siculo-Tunisian strait region (area of transition from the western Mediterranean basin to the eastern one). Analysis of partial sequence of mitochondrial COI gene and of the internal transcribed spacer region (ITS-1) revealed significant clinal changes in haplotypes frequencies between eastern and western samples at the focal COI haplotype and at three out of five focal ITS1 haplotypes. In the present study, no significant difference was found among groups. However, high frequencies of rare and unique haplotypes could reflect the effects of a recent demographic expansion which would mask a real ancient and significant genetic differentiation displayed by the two basins. Adaptive response to salinity stress in R. Decussatus was evaluated by the study of an enzymatic marker (Lap -1). Experiments carried out in hypo osmotic and hyper osmotic stress showed that the Tunisian clam is well adapted to salinity variations between 10ppm and 50ppm. The Adaptive capacity to different salinities seems to be not related to Lap-1 which was polymorphic in the Tunisian clam, on the contrary to R. Decussatus from Brittany.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (162 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 106-117. Notes bibliogr.

Où se trouve cette thèse\u00a0?

  • Bibliothèque : Bibliothèque interuniversitaire de santé (Paris). Pôle pharmacie, biologie et cosmétologie.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : MFTH 8901
  • Bibliothèque : Muséum national d'histoire naturelle. Bibliothèque centrale.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : TH 2010 -- 11
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