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Thèse soutenue

Flux géniques et dispersion chez un rongeur à démographie cyclique dans un paysage agricole intensif

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Auteur / Autrice : Bertrand Gauffre
Direction : Vincent Bretagnolle, Jean-François Cosson
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie des populations et écologie
Date : Soutenance en 2009
Etablissement(s) : Montpellier 2

Résumé

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La dispersion est un trait d'histoire de vie qui joue un rôle majeur dans le fonctionnement des populations naturelles. Comprendre ce phénomène et son évolution est aujourd'hui déterminant pour la gestion des populations dans des écosystèmes de plus en plus anthropisés. Cette étude s'est attachée à caractériser la dispersion et ses déterminants chez le campagnol des champs, Microtus avalis, dans un paysage agricole de l'Ouest de la France. L'instabilité spatio-temporelle des agro-écosystèmes et sa démographie cyclique font de ce petit rongeur colonial un modèle exceptionnel pour aborder cette problématique. La constitution d'une banque de marqueurs microsatellites nous a permis d'utiliser des approches de génétique des populations et de génétique paysagère. Une seule entité génétiquement homogène couvre les 500 km² du site d'étude bien que les distances de dispersion inférée soient faibles. Le patron d'isolement par la distance qui caractérise cette population indique que seule la distance limite le flux génique dans ce paysage. La densité influence positivement le flux génique en faisant varier la balance entre dispersion efficace et dérive génétique au cours des cycles. Nous montrons que les patrons de dispersion sont différents entre mâles et femelles (dispersion biaisée vers les mâles) suggérant que la dispersion n'est pas déterminée par les mêmes causes évolutives selon le sexe. La colonisation par les femelles des habitats temporaire (les cultures annuelles), particulièrement massive lors des pullulations, permet la cohésion spatiale de la population. Sa cohésion génétique est assurée par les migrations répétées des mâles entre colonies pour la reproduction. Ce fonctionnement est rendu possible par l'extrême rapidité cycle de vie du campagnol des champs qui compense l'instabilité du paysage. L'intégration des différents résultats de cette étude dans un modèle de dispersion couplé à un modèle dynamique de paysage devrait permettre d'évaluer l'impact de l'évolution de l'agriculture sur cette espèce emblématique de la biodiversité de ces paysages.