Caractérisation biochimique de la protéine de capside du virus de l'hépatite C : étude de son domaine d'interaction avec les gouttelettes lipidiques et mise en évidence de formes alternatives

• Auteur / Autrice : Steeve Boulant
• Direction : Jean-Pierre Lavergne
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biochimie
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Lyon 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Dimères

Lipides

Virus de l'hépatite C

Protéines virales

Résumé

La protéine de capside (appelée également "Core") du virus de l'hépatite C est l'élément protéique essentiel pour la formation de la nucléocapside et, en outre, est soupçonnée d'être à l'origine des stéatoses rencontrées chez les patients infectés. En effet, core est détectée au niveau des gouttelettes lipidiques qui sont un marqueur histologique de cette pathologie. Dans cette étude nous avons d'une part, biochimiquement caractérisé la protéine core, et d'autre part, précisément identifié son domaine responsable de l'interaction avec les gouttelettes lipidiques. Ainsi, nous avons montré que core se comporte comme une protéine mambranaire, majoritairement constituée d'hélices α (50 % de sa séquence) et est présente sous forme d'un équilibre monomère/dimère. Le domaine responsable de son ancrage aux gouttelettes lipidiques a été isolé, il s'agirait d'une hélice α amphiphile qui interagirait à plat à la surface des gouttelettes. Dans un dernier temps, nous avons mis en évidence l'existence de formes alternatives de la protéine core résultant d'un décalage de la phase de lecture lors de la traduction de l'ARN codant cette protéine. Cette étude permet de définir la protéine core comme une protéine membranaire et, la découverte de formes alternatives de cette protéine amène à réévaluer les nombreuses activités précédemment rapportées pour core