Recherche Avancée

Thèse soutenue

Dynamique des éléments transposables de type rétroposon chez les muridés : cas des familles multigéniques GAPDH et LINEL

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Auteur / Autrice : Pascale Garcia
Direction : François Bonhomme
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie
Date : Soutenance en 1994
Etablissement(s) : Montpellier 2

Résumé

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Ce travail aborde les deux principales voies d'accès à l'étude de la dynamique évolutive des familles retro posées chez les muridés: évolution concertée par séquençage dans la famille multigènique de la glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (gapdh), et mécanismes de clairance par suivi de copies individualisées dans la famille line1 (l1). Dans la première partie, nous avons montré que la famille gapdh, qui a été l'objet d'une amplification récente chez les muridés, est toujours active, génère de nouveaux pseudogènes et se structure en sous-familles. L'évolution concertée au sens strict peut expliquer l'homogénéisation à long terme des vieilles séquences et la formation de sous-familles. La deuxième partie de cette étude a apporté des enseignements intéressants concernant l'évolution et la mobilité des éléments de la famille line1. En particulier, nous avons montré que la majorité des éléments l1 (100 000 copies chez les mammifères) est insérée dans des régions particulières de l'ADN, riches en autres éléments répètés et en séquences pseudo-uniques probablement très recombinées. Les familles retro posées dépendraient donc de l'activité de quelques progéniteurs qui émettent des pseudogènes allant s'intégrer massivement dans des régions particulières. Celles-ci, grâce à leur pauvreté en gènes actifs, peuvent être purgées par des évènements de recombinaison/délétion (mécanismes de clairance)