Etude en microscopie cryogénique des complexes d'initiation de la traduction de Staphylococcus aureus

Cryo-electron microscopy study of translation initiation complexes from Staphylococcus aureus

• Auteur / Autrice : Margarita Belinite
• Direction : Marat Yusupov, Yaser Hashem
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biophysique et biologie structurale
• Date : Soutenance le 21/10/2019
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Yves Mechulam
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Marat Yusupov, Yaser Hashem, Yves Mechulam, Fabien Darfeuille, Célia Plisson-Chastang, Gulnara Yusupova
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Yves Mechulam, Fabien Darfeuille

Mots clés

Mots clés contrôlés

Initiation de la traduction

Cryotechnique

Staphylocoque doré

Traduction génétique

Mots clés libres

Staphylococcus aureus

Cryo-EM

Initiation de la traduction

Ribosome

Staphylococcus aureus

Cryo-EM

Translation initiation

Ribosome

Résumé

La synthèse des protéines, également appelée traduction de l'ARNm, est un processus conservé dans toutes les cellules vivantes. L'initiation de la traduction est une étape hautement régulée qui peut avoir plusieurs caractéristiques propres aux bactéries dites «à Gram positif ». Un exemple de bactérie à Gram positif est le S. aureus, qui provoque de nombreuses infections nosocomiales et développe une résistance aux antibiotiques les plus couramment utilisés. Dans la plupart des cas, le ribosome est la cible d'antibiotiques pouvant agir à l'étape d'initiation de la traduction. Chez S. aureus, cette étape, présente des caractéristiques propres telles que l’absence de protéine ribosomale S1, l’extension de l’hélice 26 de l’ARNr 16S, des ARNm spéciaux impliqués dans la virulence et éventuellement d’autres caractéristiques affectant la synthèse des protéines. En conséquence, les structures obtenues des complexes d'initiation aideront à approfondir nos connaissances des aspects spécifiques de la synthèse protéique de cette bactérie.Les connaissances acquises au cours de mes travaux pourront permettre de renforcer lutter contre cet agent pathogène

Protein synthesis, also called mRNA translation, is a conserved process in all living cells. It can be divided into 4 main steps: initiation, elongation, termination and recycling.Translation initiation is a highly regulated step that has several features unique to gram-positive bacteria. One example of gram-positive bacteria is a human pathogen Staphylococcus aureus that causes several nosocomial infections and develops resistance to most commonly used antibiotics. Often, the ribosome is the target of antibiotics that can act at the translation initiation step. This step in S. aureus has its own characteristics like the absence of r-protein S1, extension of the helix 26 of 16S rRNA, special virulence mRNAs and possibly other features affecting protein synthesis. As a result, obtained structures of the initiation complexes will help in gaining deeper insight on the species- specific features of protein synthesis of this bacterium.The knowledge gained during my work will be used in further research and willhopefully contribute to the fight against this pathogen.