Évolution de la virulence de V. crassostreae en lien avec l’huître en tant qu’hôte et les phages en tant que prédateurs

Evolution of Vibrio crassostreae virulence in relation to the oyster as a host and phages as predators

• Auteur / Autrice : Damien Piel
• Direction : Frédérique Le Roux
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance le 10/12/2019
• Etablissement(s) : Sorbonne université
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Complexité du vivant (Paris)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire de biologie intégrative des modèles marins (Roscoff, Finistère ; 2014-....)
• Jury : Président / Présidente : Marcelino Suzuki
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Yannick Labreuche
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Marie-Agnès Petit, Caroline Montagnani

Mots clés

Mots clés contrôlés

Relations hôte-bactérie

Bactéries pathogènes

Infections à Vibrio

Crassostrea

Mots clés libres

Vibrio

Interactions hôte/parasite

Emergence de pathogènes

Bactériophages

V. crassostreae

Mécanismes moléculaires

Vibrio

Host/parasite interactions

Pathogen emergence

Bacteriophages

Résumé

La compréhension de la dynamique écologique et évolutive des agents infectieux est importante pour diagnostiquer, prédire et prévenir les maladies chez les espèces d'élevage et sauvages. L'objectif général de ce projet est d'étudier l'évolution de la virulence de V. crassostreae en relation avec l'huître en tant qu'hôte et les phages en tant que prédateurs. Nous avons identifié des mécanismes moléculaires à l’origine de l’adaptation des vibrios avec l’huître creuse. Nous avons démontré l’émergence de souches virulentes de V. crassostreae en zone impactée par le syndrome de mortalité des huîtres juvéniles. L’émergence de V. crassostreae plus virulent est liée à l’acquisition d’un plasmide codant un système de sécrétion de type 6 responsable d’une activité létale contre les hémocytes de l’huître. Ce projet fournit également des connaissances sur les interactions entre V. crassostreae et les phages tels que l’identification de l’unité de prédation ainsi que de potentiels mécanismes impliqués dans la résistance des souches et la virulence des phages. Il s’agit d’une première étape vers le développement de stratégies prophylactiques ou thérapeutiques respectueuses de l’environnement.

Understanding the ecological and evolutionary dynamics of infectious agents is important for diagnosing, predicting and preventing diseases in farmed and wild species. This project was aimed at studying the evolution of V. crassostreae virulence in relation to the oyster as a host and to the phages as predators. We identified the molecular mechanisms leading to the adaptation of vibrios to oysters. We demonstrated the emergence of virulent strains of V. crassostreae in the area impacted by the juvenile oyster mortality syndrome. The emergence of more virulent V. crassostreae strains is linked to the acquisition of a plasmid encoding a type 6 secretion system responsible for lethal activity towards oyster hemocytes. This project also provides knowledge on the interactions between V. crassostreae and phages such as the identification of the predation unit as well as potential mechanisms involved in strain resistance and phage virulence. This represents a first step towards the development of prophylactic ecofriendly strategies.