Bibliothèque de peptides dynamiques fondés sur la ligation chimique native réversible

Libraries of dynamic peptides based on reversible native chemical ligation

• Auteur / Autrice : Cristian-Victor Rete
• Direction : Nicolas Giuseppone
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance le 28/09/2018
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut Charles Sadron (Strasbourg ; 1985-....)
• Jury : Président / Présidente : Ludovic Jullien
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Vladimir Torbeev
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Ludovic Jullien, Sébastien Ulrich

Mots clés

Mots clés contrôlés

Médicaments -- Conception

Intéines

Liaisons covalentes

Peptides

Mots clés libres

Anticorps

Peptide

Biochimie

Supramoleculaire

Dynamique

Methodologie

Découvertes du médicament

Antibody

Peptide

Biochemistry

Drug Discovery

Dynamic

Supramolecular

Methodology

Résumé

La possibilité d'utiliser une nouvelle méthodologie pour l'échange de liaisons peptidiques dans des conditions aérobiques et biocompatibles a été étudiée. Nous décrivons l'optimisation de la ligation chimique native combinatoire dynamique (dynNCL) au niveau d'un résidu N-méthylcystéine en utilisant des peptides modèles. Nous employons en outre cette méthode optimisée pour le criblage de bibliothèques de peptides combinatoires dynamiques en présence et en l'absence d'un gabarit de type anticorps. L'effet que l'incorporation d'une jonction dynamique au sein de ligands non-anticorps a sur l'affinité a également été étudié. Nous proposons que dynNCL peut être utilisé pour la conception d'une nouvelle classe de séquences pouvant potentiellement conduire au premier exemple d'épissage de protéines artificielles.

The possibility to use a new methodology for peptide bond exchange in aerobic biocompatible conditions has been investigated. We describe the assay optimization of dynamic combinatorial native chemical ligation (dynNCL) at the N-methyl-cysteine residue using model peptides. We further employ this optimized method for the screening of dynamic combinatorial peptide libraries in the presence and the absence of an antibody template. The effect that dynamic junction incorporation into non-antibody ligands has upon affinity was also studied. We propose that dynNCL can be used for the creation of a new class of designer sequences which can potentially provide the first example of artificial protein splicing.