Thèse soutenue

Le comment et le pourquoi de l’évolution des branches ventrales entre Drosophila santomea et Drosophila yakuba : bases génétiques, variation naturelle et plasticité d’une différence de forme liée à la spéciation
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Auteur / Autrice : Alexandre E. Peluffo
Direction : Virginie Courtier-OrgogozoFrançois Graner
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé. Génétique
Date : Soutenance le 04/09/2017
Etablissement(s) : Sorbonne Paris Cité
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Bio Sorbonne Paris Cité (Paris ; 2014-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut Jacques Monod (Paris ; 1997-....)
établissement de préparation : Université Paris Diderot - Paris 7
Jury : Président / Présidente : Catherine Montchamp-Moreau
Examinateurs / Examinatrices : Virginie Courtier-Orgogozo, François Graner, Catherine Montchamp-Moreau, Johannes Jäger, Benjamin Prud'homme, Frédérique Fourcade-Peronnet, Pierre-Henri Gouyon, Catherine Damerval
Rapporteurs / Rapporteuses : Johannes Jäger, Benjamin Prud'homme

Résumé

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La thèse aborde le problème de l’évolution de la forme à travers l’exemple d’une différence de forme de branches ventrales mâles liée à l’isolement reproducteur chez deux espèces soeurs : Drosophila yakuba et Drosophila santomea. L’objectif de ce travail est d’identifier les gènes impliqués dans l’évolution de cette différence de forme ainsi que les causes évolutives de cette différence entre espèces. Dans une première partie, la thèse interroge la notion de “gène” et sa recherche. Puis sont caractérisées, dans un cadre formel, les questions de type "comment" et "pourquoi" et leur lien avec la distinction causes prochaines/causes ultimes ou évolutives. Ces réflexions philosophiques sont ensuite reliées à l’Evo-Devo et au projet expérimental. Dans la deuxième partie, par morphométrie géométrique et une nouvelle méthode de génotypage à haut débit, le MSG, nous identifions un locus de 2.7 méga-bases situé sur le chromosome 3L comme étant impliqué dans l’évolution de la forme des branches ventrales entre D. yakuba et D. santomea. Ces résultats sont mis en perspective avec notre analyse quantitative de la variation de forme dans plusieurs souches naturelles, souches de laboratoire et souches élevées à différentes températures qui apportent des indices sur les causes évolutives de cette différence de forme