Stratégies de marquage chimiospécifique et bioorthogonale pour l’analyse métabolomique des rétinoïdes

Chemo-specific and bioorthogonal labeling strategies for metabolomic analysis of retinoids

• Auteur / Autrice : Éric Thomas
• Direction : Alain Wagner, Wojciech Krezel
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance le 29/09/2017
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Conception et application de molécules bioactives (Strasbourg ; 2009-....)
• Jury : Président / Présidente : Eric Defrancq
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Eric Defrancq, Gilles Subra

Mots clés

Mots clés contrôlés

Métabolomique

Sondes moléculaires

Aldéhydes

Métabolites

Rétinoïdes

Mots clés libres

Chimie bioorthogonale

Metabolomic

Retinoids

Bioorthogonal chemistry

Résumé

Ce travail est composé de trois projets. Le premier projet a pour objectif de découvrir de nouveaux métabolites de la vitamine A. Il a consisté en la synthèse d’un analogue du rétinaldéhyde, portant une fonction azoture et permettant de suivre son devenir in vivo. Le second projet a consisté en l’élaboration de la sonde ATPP permettant l’analyse de l’ensemble des métabolites aldéhydiques d’un échantillon. La sonde permet un gain de sensibilité en LS-MS². Une analyse de sa biodistribution a été faite, et montre que la sonde ATPP, après injection intrapéritonéale, est distribuée in vivo. Concernant le troisième projet, un réactif de couplage homobifonctionnel « thiol-thiol » a été élaboré. Les produits du couplage ont montré une excellente stabilité plasmatique. Le réactif a d’abord été appliqué avec succès au couplage de petites molécules, puis au couplage d’un oligonucléotide modifié et d’un peptide.

This work consists of three projects. The first project aims to discover new metabolites of vitamin A. An analog of retinaldehyde, carrying an azide function was synthesized. It would allow to follow its fate in vivo. The second project consisted in the development of a probe allowing the analysis of all the aldehyde metabolites in a sample. The probe provides sensitivity gain in LS-MS². An analysis of its biodistribution has been done, and showed the ATPP probe is distributed after an intraperitoneal injection. Concerning the third project, a homobifunctional coupling reagent "thiol-to-thiol" has been developed. The coupling products showed excellent plasma stability. The reagent was first successfully applied to the coupling of small molecules and then to the coupling of a modified oligonucleotide and a peptide.