Ré-émergents virales pathogènes humains de la République de Djibouti (Afrique) : Rapport sur la pandémie de grippe A/H1N1/2009 et Arbovirus épidémiologie

Re-emerging human viral pathogens of the Republic of Djibouti(Africa) : Reporting on Pandemic Influenza A/H1N1/2009 and arboviruses epidemiology

• Auteur / Autrice : Fred Nyamwata Andayi
• Direction : Xavier de Lamballerie
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Pathologie humaine. Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 11/06/2014
• Etablissement(s) : Aix-Marseille en cotutelle avec École des hautes études en santé publique (Rennes)
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Unité des virus émergents (Marseille)
• Jury : Président / Présidente : Jean-Louis Mège
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Xavier de Lamballerie, Jean-Louis Mège, Antoine Flahault, Isabelle Leparc-Goffart
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Antoine Flahault, Isabelle Leparc-Goffart

Mots clés

Mots clés contrôlés

Infections à arbovirus

Pandémies

Grippe humaine

isolement et purification

Sous-type H1N1 du virus de la grippe A

épidémiologie

Djibouti

Mots clés libres

Arbovirus

Vecteurs

'épidémiologie

De Djibouti

Corne de l'Afrique

H1n1

Grippe

Méditerranée orientale

Prévalence

Pandémie de grippe

Santé publique.

Arbovirus

Vector-Borne

Epidemiology

Djibouti

Horn of Africa

H1n1

Influenza

Eastern Mediterranean

Prevalence

Pandemic influenza

Public health

Résumé

Objectif de la thèse est de fournir République de Djibouti inventaire de la pandémie de grippe A/H1N1/2009-H1N1p et arbovirus hiver 2010. Elle a confirmé la capacité de surveillance locale pour détecter la grippe SG pic lors de la première vague de la pandémie, dont le profil était compatible avec H1N1p. Dans l'enquête CoPanFlu, une prévalence élevée (30%) de H1N1p a été confirmée par la jeune et District 4 résidents (plus de inégalités sociales) portant le plus lourd fardeau. Par conséquent, le contrôle futur de SG exigerait une approche queue pour atteindre des individus spécifiques et vulnérables. L'absence de données de surveillance robustes dans les pays du Sud pourrait être responsable de la sous-estimation de la charge, même lorsque le profil de la maladie ressemblait à ceux des pays développés. Sur arbovirus, la plupart des facteurs prédictifs de cas étaient statistiquement mieux décrits par de l'espace de logement et les caractéristiques environnementales du quartier, qui en corrélation avec les acteurs écologiques de leurs vecteurs de la survie des individus dans la niche locale. Cela confirme circulations arbovirus autochtones dans la République de Djibouti et a fourni l'inventaire pour la cartographie des risques et les futurs programmes de prévention et de contrôle. Les arbovirus sont les plus répandus dans le centre-ville (quartier 1), mais des cas ont diminué vers la périphérie de la banlieue (District 4). L'inverse est vrai pour les cas de grippe, ce qui démontre que des solutions sur mesure convenant à un des besoins de santé de la région, se garantir un rendement optimal sur les ressources allouées.

Thesis purpose was to provide Republic of Djibouti inventory of pandemic Influenza A/H1N1/2009 (H1N1p) and arboviruses events in the winter of 2010. The demonstrated local surveillance was capable of detecting (influenza) ILI peaking during the first pandemic wave, whose profile was consistent with H1N1p. In a Copanflu investigation that occurred during second pandemic wave, a high prevalence (30%) of H1N1p was confirmed and conspicuously, the young and District 4 residents (highest social inequalities) bored the greatest burden. Therefore, concluded that future ILI control would require a tailed approach to reach specific and vulnerable individuals. Lack of robust ILI data from surveillance in southern countries could be responsible for the underestimation of burden, even when the illness profile resembled those of developed countries. On arboviral, most case predictors were statistically best described by individuals' housing space and neighbourhood environmental characteristics, which correlated with the ecological actors of their respective transmission vectors' survival in the local niche. This study confirmed autochthonous arboviral circulations in the republic of Djibouti and provided an epidemiological inventory for risk mapping and future prevention and control programs. The arboviruses were most prevalent in city centre (District 1), but cases declined towards the periphery of the suburb (District 4). The inverse was true for pandemic and ILI cases, demonstrating that a tailored solutions suiting local area health needs, would guarantee an optimal return on allocated resources.