Analyse différentielle Tumeur Primitive / Métastase : impact sur la détermination des facteurs prédictifs de réponse et sur la compréhension des mécanismes du processus métastatique

Differential analysis of primary tumor and metastasis : impact on predictive biomarkers identification and understanding of the mechanisms of metastasis

• Auteur / Autrice : Stéphane Vignot
• Direction : Jean-Charles Soria
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Cancérologie : Biologie, Médecine, Santé
• Date : Soutenance le 15/10/2013
• Etablissement(s) : Paris 11
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Cancérologie : Biologie, Médecine, Santé (2000-2015 ; Le Kremlin-Bicêtre, Val-de-Marne)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Prédicteurs moléculaires et nouvelles cibles en oncologie (Villejuif, Val-de-Marne ; 2010-....)
• Jury : Président / Présidente : Martin Schlumberger
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean-Charles Soria, Martin Schlumberger, Frédérique Penault-Llorca, Julien Mazières, Fabrice André
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Frédérique Penault-Llorca, Julien Mazières

Mots clés

Mots clés contrôlés

Dissertations universitaires

Instabilité du génome

Oncogènes

Métastases

Mots clés libres

Tumeur primitive

Métastase

Discordance

Processus métastatique

Primary tumors

Metastasis

Discrepancies

Metastastic process

Résumé

La variabilité spatiale et temporelle des biomarqueurs entre tumeur primitive et métastase est une question clé à une époque où une meilleure individualisation des thérapeutiques est vivement attendue par les cliniciens, les chercheurs et les patients. Le projet de la thèse est de préciser les profils moléculaires différentiels entre tumeur primitive et métastases. Des échantillons conservés congélation issus de deux cohortes de patients ont été considérés : cancer bronchique non à petites cellules (15 patients) et cancer colorectal (13 patients, dont 11 patients avec contrôle de tissus sains). Ces prélèvements ont été analysés par séquençage haut débit et en expression génique afin d'étudier l'hétérogénéité tumorale lors de la progression métastatique et ainsi que les voies potentiellement impliquées dans le processus métastatique.Une forte conservation des profils génomiques est observée à la première progression métastatique pour les gènes récurrents des cancers bronchiques non à petites cellules et des cancers colorectaux. Si les études d'expression génique ne permettent pas de mettre en évidence de profil spécifique de la métastase, elles apportent des éléments utiles sur la conservation de certaines voies importantes dans les processus oncogéniques, identifient des gènes d'intérêt particulier dans l'étude de la progression métastatique et soulignent l'impact de l'effet tissu pour les analyses d'expression.

The question of spatial and temporal variability of biomarkers in solid tumors is a key issue in an era where personalized therapy is strongly advocated by clinicians, researchers and patients. The purpose of the work is to compare molecular profiles of primary tumor and matched metastasis in order to precise tumor heterogeneity during metastatic progression and to investigate pathways potentially involved in the metastatic process.Frozen samples from two cohorts of patients were considered: non-small cell lung cancer (15 patients) and colorectal cancer (13 patients, 11 patients with healthy control tissues). These samples were analyzed by high-throughput sequencing and gene expression. Highly conserved genomic profiles were observed in the first metastatic progression for known recurrent genes in non-small cell lung cancer and colorectal cancer. If gene expression studies do not highlight specific profile of metastasis, they provide useful data on the conservation of some important oncogenic pathways; identify genes of interest in the study of metastatic progression and highlight the putative impact of the effect of healthy tissue for expression analysis.