Circulation, diversité génétique et évolution des entérovirus humains au Cameroun : interaction avec les poliovirus vaccinaux et les entérovirus simiens

par Serge Alain Sadeuh Mba

Thèse de doctorat en Virologie

Sous la direction de Francis Delpeyroux et de Wilfred F. Mbacham.

Soutenue en 2013

à Paris 7 en cotutelle avec l'Université de Yaoundé 1 .


  • Résumé

    La diversité génétique des entérovirus (EVs) humains, y compris les poliovirus (PVs), circulant au Cameroun a été évaluée d'une part sur tout le territoire chez des patients atteints de paralysie flasque aiguë, et d'autre part, chez des enfants sains dans la région de l'extrême Nord du pays. Les résultats obtenus indiquent une fréquence élevée couplée à une importante diversité génétique des EVs au Cameroun. Les EVs de l'espèce Human Enterovirus C (HEV-C) représentaient jusqu'à 56,5% des isolats identifiés. En dehors des types viraux mondialement distribués, des types et variants d'EV spécifiquement Africains ont été identifiés. L'étude des échanges génétiques entre HEV-C, incluant les PVs vaccinaux, a confirmé que des recombinaisons fréquentes dans les régions non structurales du génome participent à leur diversité génétique. En particulier les PVs co-circulent et échangent les séquences de leurs régions non structurales avec les autres HEV-C notamment avec les CVA-13, -17 et -20. La co-circulation des PVs et de divers HEV-C pourrait constituer un facteur viral majeur pour l'émergence des PVs recombinants pathogènes dérivés du vaccin (VDPVs). Par ailleurs, des EVs typiquement simiens, mais aussi des EVs précédemment connus comme étant des pathogènes humains ont été identifiés dans les selles de primates non humains (PNH) vivant en captivité et en faune sauvage. En particulier, quatre nouveaux types d'EVs simiens ont été identifiés. Les résultats confirment que la transmission inter-espèces d'au moins certains types d'EV est naturellement possible et pourrait jouer un rôle dans l'émergence de nouveaux EVs de l'homme chez les PNH et vice-versa.

  • Titre traduit

    Circulation, genetic diversity and evolution of human enteroviruses in Cameroon - interactions with vaccine polioviruses and simian enteroviruses


  • Résumé

    The genetic diversity of human enteroviruses (EVs), including polioviruses (PVs), circulating in Cameroon was investigated in acute flaccid paralysis patients throughout the entire territory as well as in healthy children from the far northern region of the country. The results showed a high frequency combined with a high genetic diversity of human EVs in Cameroon. The frequency of EVs belonging to the Human Enterovirus C species (HEV-C) was as high as 56. 5% of the identified isolates. Apart from worldwide distributed types, several African specific types and variants were identified. The investigation of genetic exchanges between HEV-C, including vaccine polioviruses, confirmed the fact that frequent recombination in the non structural regions of the genome contribute to their genetic diversity. PVs in particular co-circulate and exchange the sequences of their non structural regions with CVA-13, -17 and -20. The co-circulation of PVs and diverse HEV-C may be a major viral factor for the emergence of pathogenic recombinant vaccine¬derived PVs (VDPVs). In the other hand, simian specific EVs as well as EVs previously known human EVs were identified in the stools of captive and wild non human primates (NHP). Four novel types of simian EVs in particular were identified. The results confirm that cross-species transmission of at least some EV types can happen naturally and could play a role in the emergence of new EV types from humans to NHP and vice-versa.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (277 p.)
  • Annexes : 324 Réf.

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  • Bibliothèque : Université Paris Diderot - Paris 7. Service commun de la documentation. Bibliothèque Universitaire des Grands Moulins.
  • PEB soumis à condition
  • Cote : TS (2013) 224
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