Aldéhyde déshydrogénases non phosphorylantes : importance de la dynamique structurale au cours de la catalyse

par Raphaël Bchini

Thèse de doctorat en Sciences de la vie et de la santé

Sous la direction de François Talfournier et de Sophie Rahuel-Clermont.

Le président du jury était Éric Gelhaye.

Le jury était composé de Isabelle André.

Les rapporteurs étaient Corinne Lionne, Fernando Rodrigues-Lima.


  • Résumé

    Une caractéristique essentielle du mécanisme catalytique des ALDH est l'importance de la flexibilité et de la dynamique conformationnelle dans le site actif, incluant les chaînes latérales de résidus, le substrat, et le cofacteur. Ma thèse a permis d'identifier des bases responsables de la reconnaissance du rétinal contrôlant la biosynthèse de l'acide rétinoïque dans les RALDH. J'ai ensuite pu suivre le basculement du cofacteur réduit en utilisant le FRET, ce qui m'a permis d'établir un modèle cinétique pour déterminer la constante de vitesse associée à cette étape. Enfin, les résultats obtenus pour identifier les bases moléculaires responsables de la dissociation tardive ou précoce du cofacteur réduit ont montré que le mode de stabilisation du cofacteur est à l'origine de cette différence entre ces deux familles d'enzymes

  • Titre traduit

    Aldehyde Dehydrogenase non phosphorylating : Importance of structural dynamics during catalysis


  • Résumé

    An essential feature of the catalytic mechanism of ALDH is the importance of flexibility and conformational dynamics in the active site, including the side chains of residues, substrate and cofactor. My thesis has identified bases responsible for the recognition of retinal controlling biosynthesis of retinoic acid in RALDH. I was then able to follow the flip of the cofactor reduced by using FRET, which allowed me to develop a kinetic model to determine the rate constant associated. Finally, the results obtained to identify the molecular basis responsible for late or early dissociation of the reduced cofactor showed that the mode of stabilization of the cofactor is the origin of this difference between these two families of enzymes


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