Étude des interactions et de l’orientation d’un peptide cationique dans différents systèmes membranaires biomimétiques

par Imene Saadallah

Thèse de doctorat en Sciences. Biochimie

Sous la direction de Catherine Sarazin et de Olivier Wattraint.

Soutenue en 2012

à Amiens .


  • Résumé

    Ces travaux de thèse s’inscrivent dans la thématique de recherche concernant l’étude des interactions entre des peptides membranaires et des bicouches lipidiques modèles. Un peptide cationique (K2LA12) composé d’une longue partie hydrophobe a été synthétisé afin de mimer un segment transmembranaire de protéines. Les interactions de ce peptide avec des modèles membranaires ont été étudiées par différentes techniques physico-chimiques telles que la RMN des solides, la diffusion de la lumière ou le dichroïsme circulaire. Différentes compositions en phospholipides ont été choisies afin de mettre en évidence l’influence de l’épaisseur de la région hydrophobe et de la charge globale des bicouches lipidiques sur la conformation, les interactions et l’orientation du peptide. La première partie de ces travaux consacrée aux études par dichroïsme circulairea montré que le peptide adoptait majoritairement une structure en hélice α dans le TFE ou le méthanol mais également au sein des bicouches lipidiques. La seconde partie du mémoire présente les résultats des expériences de RMN du deutérium et montre que ce peptide augmente l’ordre des bicouches lipidiques zwitterioniques comme le DMPC et très faiblement celui de bicouches de PC/PG. Enfin, les expériences de diffusion de la lumière ont montré que la taille des liposomes utilisés pour construire notre modèle de bicouches lipidiques supportées était dépendante du nombre de cycles de sonication et de la proportion en peptide introduite. Les études par RMN des solides du deutérium et de l’azote-15 en rotation à l’angle magique pour deux modèles de bicouches lipidiques supportées et orientées ont montré un bon alignement des bicouches lipidiques mais aucune orientation particulière de ce peptide.

  • Titre traduit

    Interaction and orientation studies of cationic peptide in different biomimetic membrane models


  • Résumé

    This is in line with the research topic concerning the studies of interactions between peptides and membrane lipid models. A cationic peptide (K2LA12) composed of a long hydrophobic part has been synthesized to mimic a transmembrane segment of membrane proteins. Interactions of the peptide with model membranes were investigated through several physicochemical tools such as Solid-State NMR, light scattering or circular dichroism. Various compositions of phospholipids were selected to highlight the influence of the thickness and the charges of lipid bilayers on conformation, interactions and orientation of the peptide. The first section of this work is dedicated to circular dichroism experiments and revealed that the peptide adopted a predominantly α-helical structure in TFE or methanol and also in lipid bilayers. The second part of this work delt with the results of 2H NMR experiments and demonstrated that the peptide increased the order parameter of zwitterionic lipid (DMPC) and had no effect on PC/PG bilayers. Lastly, light scattering studies have demonstrated that the size of vesicles used to build supported lipid bilayers was dependent on sonication cycles or the peptides ratio. The alignment of lipids and the orientation of the peptide were investigated by 2H and15N SS-NMR experiments.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (184 p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 166-184

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  • Bibliothèque : Université de Picardie Jules Verne. Bibliothèque universitaire. Section Sciences.
  • Disponible pour le PEB
  • Cote : T 51 2012-6
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