Structure des assemblages de poissons endémiques de la partie haute fleuve Yangtze : differenciation de population d'une espèce en danger (Gobiocypris rarus)

Structure of endemic fish assemblages in the upper Yangtze river basin and population differentiation of an endangered endemic fish (Gobiocypris rarus)

• Auteur / Autrice : Yongfeng He
• Direction : Sovannarath Lek, Wenxuan Cao
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aquatique ecology
• Date : Soutenance en 2010
• Etablissement(s) : Toulouse 3 en cotutelle avec Institut d’Hydrobiologie (Wuhan), Chine

Mots clés

Mots clés contrôlés

Variabilité génétique

Biocénoses

Génétique des populations

Chine

Yangzijiang (Chine ; cours d'eau)

Poissons

Mots clés libres

Poissons

Génétique des populations

Microsatellite

Ecologie des communautés

Morphométrie

Modélisation, classification, prédiction, SIG

Gobiocypris rarus

Yangtze, Chine

Conservation

Résumé

Le fleuve Yangtze (Changjiang en chinois) supporte une très riche biodiversité de poissons, avec environ 400 espèces au total. Assimilée à une barrière eco-fonctionnelle, la partie amont du Yangtze présente des conditions environnementales naturelles exceptionnelles, avec une hétérogeneité bien prononcée des habitats, un système de drainage bien développé, une abondance en ressources en eau and une biodiversité importante. Ainsi, on dénombre 286 espèces de poissons dans la partie amont du Yangtze, dont 124 endémiques à cette région. Cependant, cette biodiversité est fortement menacée, notamment du fait de la surexploitation, de la pollution des eaux, des barrages hydroélectriques, des invasions biologiques et des modifications environnementales. Il est de ce fait impératif de mesurer les influences de ces changements environnementaux sur la ressource piscicole, de telle sorte à accélérer la mise en place de mesures de conservation. En conséquent, cette thèse avait pour objectif d'apporter des éléments visant à favoriser la conservation des espèces endémiques de poisons dans la partie amont du fleuve Yangtze. Dans la première partie de la thèse, l'objectif est d'illustrer les mécanismes de structuration des assemblages de poissons pour améliorer les connaissances des processus écologiques de la partie amont du fleuve Yangtze, i. E. Déterminer les patrons spatiaux de distribution des poissons endémiques et les relations avec les variables environnementales (publications P1 & P2). Nous avons pu définir cinq assemblages de poissons endémiques dans le haut Yangtze caractérisés par des différences significatives au niveau de la richesse spécifique. Ces assemblages reflètent le gradient longitudinal de la distribution des espèces et de richesse avec une forte corrélation avec la topographie et la géomorphologie du fleuve Yangtze. Chaque assemblage est caractérisé par des espèces endémiques " indicatrices ". Le patron de distribution des poissons endémiques est significativement corrélé avec les facteurs environnementaux de l'utilisation du sol du bassin versant et des caractéristiques du fleuve. Des modèles mixtes utilisant simultanément des paramètres d'utilisation du sol et des caractéristiques du fleuve permettent d'assurer une meilleure prédiction de l'assemblage des poissons endémiques du Yangtze, comparés à des modèles utilisant séparément les 2 groupes de paramètres environnementaux. . .

The Yangtze River, also called Changjiang, supports rich biodiversity, especially diverse fish fauna, i. E. , about 400 fish species and subspecies. As an eco-functional barrier of the Yangtze River, the upper Yangtze River exhibits complicated natural environment, pronounced habitat heterogeneity, well-developed drainage system, abundant water resources and rich biodiversity. There were 286 fish species and subspecies distributing in the upper Yangtze River, among which 124 species were endemic. However, these fish resources are experiencing large threats: overexploitation, water pollution, hydropower projects, invasion by exotic species, and global environmental changes. It is imperative to evaluate the influences of the changes in environmental features on the fish resources and to accelerate the progress of conservation projects. Therefore, two parts of content have been studied in this thesis for the conservation of endemic fishes in the upper Yangtze River. Firstly, for the purpose of providing insight into mechanisms structuring fish assemblages and enhancing knowledge on ecological processes in the upper Yangtze River, spatial pattern of endemic fishes in the upper Yangtze River basin and their relationship with environmental features have been studied in P1 and P2 of this thesis. We identified five endemic fish assemblages in the upper Yangtze River basin. Not only species composition but also endemic species richness varied significantly among these five assemblages. They not only reflect the longitudinal gradient pattern but also are closely correlated with the topography and geomorphology of the Yangtze River. Each endemic fish assemblage has its specific indicator species. The endemic fish distribution patterns are significantly correlated with environmental factors such as land-cover features and river characteristics. The mixed models containing both land-cover features and river characteristics are more effective than any individual one in explaining complex endemic fish distribution patterns in the upper Yangtze River basin. Finally, we suggested that three key points for the conservation of endemic fishes in the upper Yangtze River basin should be paid more attention: selection of several protected sites aiming at various species; maintenance of at least one flowing reach in each river; developing the conservation of tributaries. Secondly, in order to obtain enough background of an endangered endemic fish (Gobiocypris rarus) and provide guidelines for other species conservation in the upper Yangtze River basin, the author used this Chinese rare minnow (G. Rarus) as an example to do the studies of conservation biology using microsatellite markers and morphological traits in P3, P4 and P5 of this thesis. . .