Identification et caractérisation de la mutation responsable de l'épilepsie photosensible chez la poule

• Auteur / Autrice : Marine Douaud
• Direction : Alain Vignal, Frédérique Pitel
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génétique, génomique
• Date : Soutenance en 2009
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Mots clés

Mots clés contrôlés

Épilepsie

Photodermatoses

Mots clés libres

Epilepsie photosensible

Gga25

Cartes RH

Cartographie génétique

Sv2a

Epissage alternatif

Résumé

L’épilepsie réflexe photosensible est provoquée par l’association de la sensibilité génétique ou idiopathique des individus, appelée photosensibilité, et de stimuli lumineux (télévision, jeux vidéo…). A ce jour, aucun gène n’a été identifié chez l’homme comme étant responsable de la photosensibilité génétique. La lignée Fepi, un modèle génétique poulet qui présente une prédisposition à ce type d’épilepsie, a été utilisée dans un pedigree expérimental dédié de type backcross, qui a permis de localiser la mutation epi sur le microchromosome GGA25. L’objectif de ma thèse était d'identifier, puis de caractériser la mutation responsable de l’épilepsie photosensible du modèle poulet. Pour cela, j’ai d’abord construit la carte génétique de GGA25 et participé à la construction de la carte d’hybrides irradiés près de la mutation epi. En parallèle, j’ai participé à la construction de la carte génétique à haute résolution qui a permis de restreindre la localisation de la mutation dans un intervalle de 6,6 cM, comportant un gène candidat : SV2A (Synaptic Vesicle glycoprotein 2A), puis dans un intervalle final de 0,5 cM à l’intérieur du gène. J’ai également pu montrer que le phénotype épileptique était associé à une diminution significative de l’expression du gène SV2A chez les poulets épileptiques. Le séquençage de la région codante du gène m’a ensuite permis de mettre en évidence un épissage aberrant de l’exon 3 survenant spécifiquement chez les individus épileptiques. Enfin, j’ai pu identifier une mutation survenant dans le site accepteur de l’intron 2 pouvant expliquer l’épissage aberrant.

Photosensitive reflex epilepsy is caused by the combination of individual sensitivity, either genetic or idiopathic, with light stimuli (television, video games. . . ). To date, no gene responsible for the genetic photosensitivity has been identified in human. The chicken strain Fepi, with genetic predisposition to photosensitive epilepsy, was used in a dedicated experimental backcross pedigree, allowing the mapping of the epi mutation on microchromosome GGA25. The objective of my thesis was to identify and characterize the mutation causing photosensitive epilepsy in chicken. To this end, I first built a genetic map of GGA25 and participated in the construction of the radiation hybrid map surrounding the epi mutation. In parallel, I participated in the construction of a high resolution genetic map, restricting the location of the mutation to a first 6. 6 cM interval containing a candidate gene: SV2A (Synaptic vesicle glycoprotein 2A), and thereafter to a final interval of 0. 5 cM within the gene. I was also able to show that the epileptic phenotype was associated with a significant decrease in the expression level of SV2A in epileptic chicken. Sequencing the coding region of the gene allowed me to identify an aberrant splicing of exon 3, occuring specifically in epileptic individuals. Finally, I identified a mutation in the acceptor site of intron 2 that could be responsible for the aberrant splicing.