Etude moléculaire des réponses à la lumière chez les algues marines Phaeodactylum tricornutum et Ostreococcus tauri

Molecular study of light responses in the marine microalgae Phaeodactylum triconortum and Ostreococcus tauri

• Auteur / Autrice : Marc Heijde
• Direction : Chris Bowler
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génomique. Biologie moléculaire
• Date : Soutenance en 2008
• Etablissement(s) : Paris 6

Mots clés

Mots clés libres

Cryptochrome

Photolyase

Phaeodactylum tricornutum

Ostreococcus tauri

Lumière

Expression génique

Résumé

Le phytoplancton inclue les diatomées et les prasinophycées qui sont deux groupes d’importance écologique majeure ayant maintenant intégré l’ère de la génomique grâce au séquençage de génomes et à la disponibilité d’outils moléculaires. Dans cette thèse, j’ai travaillé avec deux espèces, Ostreococcus tauri qui est une algue verte, et Phaeodactylum tricornutum qui est une diatomée pennée. Le génome d’O. Tauri a révélé la présence de cinq gènes de la famille des cryptochromes / photolyases et j’ai poursuivi la caractérisation fonctionnelle de deux d’entre eux (expression, activité photolyase, liaison à l’ADN, chromphores et activité de répresseur transcriptionnel). En plus de l’identification de ces mêmes récepteurs dans le génome de P. Tricornutum j’ai tenté de comprendre l’effet de la qualité et du cycle de la lumière sur l’ expression de ces gènes. En parallèle j’ai construit une banque d’ESTs et développé une puce à ADN qui m’a permis de faire une étude du transcriptome en lumière bleue.