Thèse soutenue

Vers une taxonomie moléculaire des coraux du genre Pocillopora

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Auteur / Autrice : Jean-François Flot
Direction : Simon Tillier
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Systématique moléculaire
Date : Soutenance en 2007
Etablissement(s) : Paris, Muséum national d'histoire naturelle
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la nature et de l'Homme - Évolution et écologie (Paris ; 1995-....)
Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Muséum national d'histoire naturelle. Département de systématique et évolution (Paris)
Jury : Président / Présidente : Pierre-Henri Gouyon
Examinateurs / Examinatrices : Mehdi Adjeroud, Jean-Pierre Cuif
Rapporteurs / Rapporteuses : Marc-André Selosse, Ralph Tollrian

Résumé

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Les espèces de coraux du genre Pocillopora sont notoirement difficiles à identifier. Pour tenter d'y remédier, les génomes mitochondriaux de deux individus ont été séquencés, révélant la présence de deux régions variables : un cadre ouvert de lecture de fonction inconnue et la région de contrôle putative. Par ailleurs, une méthode nouvelle pour le séquençage direct de mélanges d'haplotypes a été mise au point et appliquée à l'analyse de quatre marqueurs nucléaires (l’ITS2 et trois introns) : de manière inattendue, pour chacun de ces marqueurs plus de deux séquences ont été détectées chez certains individus. L’analyse d’échantillons récoltés en diverses localités de l’océan Pacifique (Okinawa, Philippines, Nouvelle Calédonie, Hawaii, Clipperton et Mexique) suggère un nombre d'espèces de Pocillopora inférieur à ce que la variation morphologique laissait supposer, et remet en question l'hypothèse d'un centre de biodiversité du genre localisé dans le Pacifique Est