Cartographie fine d'un QTL de l'état d'engraissement sur le chromosome 5 de la poule

par Behnam Abasht

Thèse de doctorat en Biochimie. Biologie moléculaire et cellulaire

Sous la direction de Madeleine Douaire.

Soutenue en 2006

à Rennes, Agrocampus Ouest .

mots clés

• Engraissement, QTL, Cartographie fine
• Poules

Résumé

Cette étude a été menée pour cartographie finement un QTL pour l'engraissement déjà identifié sur le chromosome 5 de la poule, dans un croisement entre les lignées expérimentales grasse (LG) et Maigre (LM). L'approche " test sur descendance d'individus recombinants " a été utilisée. L'analyse QTL d'un nouveau dispositif F2, produit par un nouveau croisement entre LG et LM, nous a permis d'identifier deux mâles F1 (parmi les 3) hétérozygotes aux QTL d'engraissement du GGA5. Elle a aussi mis en évidence une interactionentre ces QTL et le sexe et permis d'identifier deux régions QTL ; l'une proximale et l'autre distale, qui contiennent respectivement un QTL mâle et un QTL femelle. Pour localiser finement ces deux QTL, 3 fils backcross recombinants de chacun des deux pères F1 hétérozygotes aux QTL ont été testés sur descendance. Afin d'identifier les points de recombinaison de nouveaux marqueurs du GGA5 ont été développés et ont permis de préciser la cartographie RH de ce chromosome. L'étude du polymorphisme de ces marqueurs par la méthode SSCP a permis d'obtenir 13 nouveaux marqueurs polymorphes dans les régions QTL. L'étude de la région QTL proximale n'a pas permis de préciser davantage la localisation du QTL. En revanche, l'analyse de la région distale à partir d'un mâle backcross 1 recombinant a permis de localiser le QTL femelle dans une régin de 6 ;9 Mb. Un QTL mâle présent dans cette même région a été analysé grâce à 2 générations sucessives d'individus backcross recombianants. Il a pu ainsi être localisé dans une région de 4,3 Mb en extrémité de GGA5.

Résumé

This study was aimed to fine map fatness QTL on chicken chromosome 5 which have been previously identified in an F2 design derived from experimental Fat and Lean lines. Analyzing a new F2 design, established from the same fat and lean lines, led to identify 2 F1 sires (out of 4 F1 sires), heterozygous for fatness QTL on GGA5. The analyses also revealed an interaction between QTL and sex giving rise to male- and female-specific QTL, located in the proximal and the distal parts of G GA5 respectively. Fine mapping of these QTL was performed by the recombinant progeny testing method in two successive backcross generations. Besides high resolution RH map of developed to refine the position of recombination events. In the first backcross generation recombinant males were progeny tested. They were descended from each of the 2 QTL heterozygous F1 sire mated to lean line females. QTL aanalyses in the backcross-2 families allowed mapping of the female QTL in lesss than 7 Mb at the distal part of GGA5. They also identified a new male QTL location in this region. The study of the proximal par of GGA5 did not allow refining the QTL location in this region. Refining of the male QTL location in the distal part of GGA5 was performed by progeny testing 3 recombinant backcross-2 males generated from the backcross-1 sire, heterozygous for the male QTL. Analyses of the backcross -3 families allowed to map this QTL to 4. 3 Mb at the distal end of GGA5.