L'élément tirant chez Drosophila simulans : invasion des populations ou disparition ?

The tirant element in Drosophila simulans : invasion of populations or disappearance ?

• Auteur / Autrice : Marie Fablet
• Direction : Cristina Vieira-Heddi
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génomique des populations
• Date : Soutenance en 2006
• Etablissement(s) : Lyon 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Évolution (biologie)

Drosophila simulans

Rétrotransposons

Drosophila melanogaster

Résumé

Longtemps considérés comme des parasites moléculaires, les éléments transposables participent en réalité au fonctionnement du génome. Tirant, un élément transposable de type rétroviral de la drosophile, est particulièrement intéressant dans le cadre de l'étude de la dynamique des séquences mobiles. En effet, seules les populations africaines de Drosophila simulans présentent des copies de tirant, les populations des autres continents en étant dépourvues. Tirant est-il en train d'envahir les populations de D. Similans à partir de l'Afrique, berceau de l'espèce, ou est-il en train de disparaître de cette espèce, ne laissant en Afrique que des reliques ? L'étude de la structure des copies de tirant dans différentes espèces de drosophile, une analyse détaillée de leur région régulatrice, ainsi que l'étude de leur activité, concluent en faveur d'un élément ancien et peu actif chez D. Simulans. Tirant semble donc être en cours de disparition du génome de cette espèce

Considered as molecular parasites for a long time, transposable elements do play a role in the way the genome works. Tirant, a retrovirus-like transposable element of Drosophila, is very interesting in the view of studying the dynamics of these mobile sequences, because only African populations of Drosophila simulans harbor copies of tirant whereas the populations from the other continents are devoid of it. The question thus arises whether tirant is in the process of invading the populations of D. Simulans from Africa, the cradle of the species, or in the process of disappearing from its host genome, leaving relics in Africa? The study of the structure of tirant copies in several Drosophila species, a focus on the regulatory region of the element, and a study of its activity reveal that tirant is actually an old element with low activity in D. Simulans. Therefore, tirant seems to be in the process of disappearing from the genome of this species.