Identification d'une nouvelle famille de GTPase de fonction biologique inconnue et Bases structurales de la reconnaissance antigénique par les lymphocytes T humains : deux approches de biologie structurale par cristallographie

par Stéphanie Gras

Thèse de doctorat en Cristallographie et RMN biologiques

Sous la direction de Dominique Housset.

Soutenue en 2006

à Grenoble 1 .

mots clés

• Structure
• HLA-A2m
• GTPases
• Cristallographie
• Interleukine 5
• Immunologie
• Hépatite C
• Protéines

Résumé

Deux types de problématiques différentes peuvent motiver l'approche structurale d'une macromolécule. Soit la fonction de cette macromolécule est inconnue et l'on détermine sa structure afin de mieux connaître sa fonction. Soit la fonction est connue et la structure va permettre de comprendre comment cette molécule remplit son rôle biologique. Durant ma thèse, j'ai eu l'occasion de pouvoir aborder deux projets qui correspondent à ces deux approches de biologie structurale. C'est pourquoi mon manuscrit décrit ces deux projets dont la démarche scientifique est différente et complémentaire pour ma formation en biologie structurale. Dans un premier temps, je décrirai les résultats obtenus sur le projet PAB0955. Ce projet avait pour objectif de déterminer la fonction de la protéine d'après sa structure. La protéine PAB0955 est de fonction biologique inconnue, elle hydrolyse le GTP et elle n'a pas de proche homologue dont la structure est connue. Notre étude a été conduite dans l'objectif extraire un maximum d'information fonctionnelle à partir des données structurales. Dans une deuxième partie, je décrirai notre étude sur des protéines du système immunitaire humain. Nous nous sommes intéressés à des molécules impliquées dans la reconnaissance d'antigène: le récepteur du lymphocyte T (TCR) et la molécule du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH). L'objectif étant de déterminer le lien entre les caractéristiques structurales d'un complexe antigène-CMH et la diversité et la fréquence des lymphocytes T activés par ce complexe. En résumé corréler les observations structurales avec les données immunologiques dont nous disposons.

Titre traduit

Identification of a new GTPase family of unknown function and the structural basis of antigenique recognition by humans T cell : two biology structural approach by cristallography

Pas de résumé disponible.

Résumé

Two differents problematics can motivate the structure determination of a maccromolecule. Either the macromoléucle function is unknow and the structure can help us to know it. Or the molecule function is know and the structure can help to know how thise molecule play its function. During my thesis, 1 had the opportunitie of working on these two structural biology approach. The first part of my hanwritten is about a nex GTPase family. This project's objective was to determine the function from the protein structure. We made a large study about the ATPase and GTPase structures in the PDB. This study is made to try know the function of our protein. The second part of my work is about the structurale basis of antigene recognition by T cel!. We focus on the structural caracteristic of peptide-MHC complex and the T cell diversity.