Analyse du transcriptome lors de l'embryogenèse précoce chez le Tournesol

Transcriptome analysis during early embryogenesis in sunflower

• Auteur / Autrice : Cecile Ben
• Direction : Laurent Gentzbittel
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biosciences végétales
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Toulouse, INPT

Mots clés

Mots clés contrôlés

Expression génique

Séquençage des acides nucléiques

Embryogenèse somatique

Banques de gènes végétaux

Tournesol

Mots clés libres

Microarray

Résumé

Afin de caractériser le transcriptome au cours de l'embryogenèse précoce chez le tournesol, des banques d'ADNc ont été construites à partir d'embryons au stade globulaire, cœur et cotylédonaire qui constituent des stades clé du développement. L'analyse in silico des EST générées a fourni un premier aperçu des fonctions cellulaires impliquées à chaque stade de développement. Ces banques d'ADNc, couplées à d'autres banques, ont ensuite été utilisées pour construire un microarray comptant 8 185 séquences uniques. Ce microarray a été hybridé avec des ADNc issus d'embryons globulaires, cordiformes et cotylédonaires. Des ADNc d'ovules non fécondés et de feuilles ont été utilisés comme témoins externes. L'analyse statistique des données de microarrays a révélé 744 gènes différentiellement exprimés entre aux moins deux conditions. L'étude du profil d'expression de ces gènes nous a permis de dégager des hypothèses sur les mécanismes induits au cours de l'embryogenèse précoce chez les plantes.