Variabilité génétique de la protéase NS3 du virus de l'hépatite C

Genetic heterogeneity of hepatitis C virus NS3 protease gene

• Auteur / Autrice : Sophie Vallet
• Direction : Bertrand Picard
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Brest

Mots clés

Mots clés contrôlés

Polymorphisme génétique

Cancer

Cirrhose hépatique

Virus de l'hépatite C

Résumé

La protéase NS3 est essentielle à la réplication du VHC et est l'une des cibles potentielles pour le développement de nouvelles thérapeutiques anti-VHC. Dans une première étude, la variabilité génétique de la protéase NS3 a été analysée pour 17 échantillons sériques pré-thérapeutiques issus de patients infectés par des VHC de génotype1 et répartis en fonction de leur réponse ultérieure à la bithérapie standard. Une certaine variabilité nucléotidique et protéique a été observée. La réponse ultérieure à la bithérapie et la variabilitéde la protéase virale n'étaient pas associées. Un profil particulier incluant 3 délétions et une insertion a été rapportée pour 4 variants issus de la quasi-espèce d'un patient. Dans une seconde étude, un profil génétique particulier en relation avec l'évolution de la cirrhose en CHC a été recherché. Aucun résidu ou motif spécifique n'a été détecté comme étant prédictif de l'évolution de la cirrhose chez une population cas/témoins de 10 patients cirrhotiques

NS3 protease is essential for HCV replication, and is one of the most promising targets for anti-HCV therapy. In a first work, the genetic heterogeneity of the protease gene was analysed in 17 HCV gentype 1 pre-therapeutic samples distributed according to their subsequent response to standard combination therapy. Variability of both nucleotide and amino acid sequences was found. No association between the outcome of bitherapy and mutational pattern before treatment was found. A particular pattern including three deletions and one insertion in four clones of the quasispecies was found for one patient. In a second work, as there are different arguments for a putative role of the HCV NS3 protease in the carcinogenesis process, we searched for a genetic pattern of NS3 protease in relation with evolution from viral cirrhosis to HCC. No specific residues or motifs were detected as predictive of cirrhosis outcome in a case controle population of 10 cirrhotic patients.