Détection et caractérisation des bactéries intracellulaires associées au champignon ectomycorhizien Laccaria bicolor S238N

• Auteur / Autrice : Joanne Bertaux
• Direction : Jean Garbaye
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie végétale et forestière
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Nancy 1
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Microscopie confocale

Hybridation in situ

Microbiologie

Ectomycorhizes

Laccaria bicolor

Résumé

Laccaria bicolor S238N est un champignon ectomycorhizien utilisé commercialement en France dans le cadre de la mycorhization contrôlée. Lors de la production de l'inoculum en fermenteur, des contaminations bactériennes apparaissent régulièrement. La technique d'hybridation in situ associée à la microscopie confocale a permis de détecter plusieurs types de bactéries intracellulaires dans les cultures pures du champignon. La majorité des endobactéries était affiliée aux Firmicutes. Certaines ont été identifiées comme des Paenibacilli appartenant à la même espèce que des bactéries isolées à partir d'une culture en fermenteur de L. Bicolor S238N. En revanche, dans des échantillons de mycélium non axéniques comme les mycorhizes, les endobactéries détectées étaient majoritairement des a-protéobactéries. Comme les observations suggèrent que certaines endobactéries colonisent des cellules fongiques vivantes, il pourrait s'agir d'un cas d'endosymbiose bactérienne.

Laccaria bicolor S238N is an ectomycorrhizal fungus used commercially in France for controlled mycorrhization. During the production of the inoculum in fermentor, bacterial contaminations occur recurrently. Fluorescent in situ hybridization associated with confocal microscopy has allowed to detect several types of intracellular bacteria in the pure cultures of the fungus. Most of these endobacteria belong to the Firmicutes. Some have been identified as Paenibacilli, and belong to the same species as bacteria isolated from a L. Bicolor S238N culture in fermentor. In contrast, in non axenic mycelium samples such as mycorrhizas, endobacteria affiliated to the a-proteobacteria were detected. Since some observations suggest that the endobacteria sometimes colonize live fungal cells, it could be a case of bacterial endosymbiosis.